FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833499

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833499
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences138974
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC46

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA105097.561846100709485No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA71955.177227395052312No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA70825.0959172219264035No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA61234.4058600889375No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA54053.889216688013585No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA44873.2286614762473556No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA36922.65661202814915No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA35682.5673867054269146No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA21441.5427346122296257No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA5440.391440125491099No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3560.25616302329932217No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3290.23673492883560954No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3280.23601536978139795No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3260.2345762516729748No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3180.22881977923928215No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3150.22666110207664744No Hit
GANTACAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3090.22234374775137794No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2990.21514815720926217No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2910.20939168477556955No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2710.19500050369133795No Hit
GANTACAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2690.19356138558291477No Hit
GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2530.18204844071552953No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2400.172694173010779No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2400.172694173010779No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG2360.1698159367939327No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2330.16765725963129793No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2280.16405946436024005No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2110.1518269604386432No Hit
GANTACTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2110.1518269604386432No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2110.1518269604386432No Hit
GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2090.15038784233022004No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2090.15038784233022004No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG2060.1482291651675853No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2050.14750960611337371No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2010.14463136989652742No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1990.14319225178810424No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1970.1417531336796811No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1960.1410335746254695No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1920.1381553384086232No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1910.13743577935441162No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1900.13671622030020003No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1900.13671622030020003No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1870.1345575431375653No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1840.13239886597493056No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTCCTCAG1830.13167930692071897No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1820.1309597478665074No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1760.12664239354123794No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG1750.12592283448702635No Hit
GANTACTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1740.12520327543281476No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1740.12520327543281476No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCCTTCGGGCCTCAA1720.12376415732439161No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1710.12304459827018002No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1670.12016636205333371No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG1640.11800768489069897No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG1630.1172881258364874No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1600.11512944867385266No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1590.11440988961964108No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG1580.11369033056542951No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCATCAG1570.11297077151121793No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG1570.11297077151121793No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1560.11225121245700634No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1550.11153165340279476No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1540.1108120943485832No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1520.10937297624016003No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG1480.10649474002331372No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAG1470.10577518096910213No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG1470.10577518096910213No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1460.10505562191489057No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1440.10361650380646739No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTACCCATGCTTTCGCTCCTCAG1430.1028969447522558No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG1430.1028969447522558No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1410.10145782664383265No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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