FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833523

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833523
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences122087
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC46

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA82396.748466257668712No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA55364.53447131963272No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA49534.056942999664174No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA43213.539279366353502No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA37363.0601128703301743No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA30622.5080475398691098No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA28722.352420814664952No Hit
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GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA17441.4284895197686895No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG15191.2441947136058713No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG14851.216345720674601No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG12631.0345081785939534No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG11620.9517802878275328No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG10040.8223643794998647No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG8220.6732903585148297No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG8220.6732903585148297No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG4950.40544857355820035No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG4170.3415597074217566No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4070.3333688271478536No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3060.2506409363814329No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG3040.24900276032665233No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2830.23180191175145595No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2780.22770647161450439No Hit
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GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2740.2244301195049432No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGTACCTCAG2720.22279194345016257No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2700.22115376739538198No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG2640.21623923923104016No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2580.21132471106669834No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2550.20886744698452742No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2380.19494295051889227No Hit
GANTACAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2240.183475718135428No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG2170.17774210194369588No Hit
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GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA2130.17446574983413465No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT2100.17200848575196379No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2070.16955122166979286No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG2040.16709395758762194No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGTACCTCAG1980.16217942942328012No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCATTATTTGAAGCGGGCTCGGAGGAAACGT1960.1605412533684995No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1950.15972216534110922No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1940.1589030773137189No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1870.1531694611219868No Hit
GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1850.15153128506720617No Hit
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GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1820.14907402098503525No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGTACCTCAG1800.14743584493025466No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1790.14661675690286435No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1780.14579766887547405No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1770.14497858084808374No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG1750.14334040479330312No Hit
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GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA1580.12941590832766797No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1380.1130341477798619No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGTACCTCAG1370.1122150597524716No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCATTATTTGAAGCGGGCTCGGAGGAAACGT1350.11057688369769099No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAG1330.10893870764291037No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1310.10730053158812979No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1310.10730053158812979No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGCATGAAGGCCTCACCCTCATGGATTT1270.10402417947856855No Hit
GANTANTCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1260.10320509145117826No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG1260.10320509145117826No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG1260.10320509145117826No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAG1250.10238600342378795No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1240.10156691539639764No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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