FastQCFastQC Report
Fri 2 Sep 2022
EGAF00004833531

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004833531
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences151531
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA108067.131214075007754No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA75304.969280213289689No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA73214.831354640304624No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA65204.3027499323570755No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA59053.8968923850565234No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA49283.252139826174182No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA41472.7367337376510417No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA38462.538094515313698No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA24131.59241343355485No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA6030.39793837564590745No Hit
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GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4970.327985692696544No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA4960.3273257617253235No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA4940.3260058997828827No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3760.2481340451788743No Hit
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GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3640.24021487352422935No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3490.2303159089559232No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA3470.22899604701348242No Hit
GACTANAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3450.22767618507104156No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA3410.22503646118615991No Hit
GANTANAAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3230.21315770370419254No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3220.21249777273297213No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA3180.2098580488480905No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA3110.2052385320495476No Hit
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GACTACAAGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC2940.19401970553880063No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2910.1920399126251394No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2880.19006011971147818No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2870.18940018874025777No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2710.17884129320073122No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2700.1781813622295108No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCATCAG2680.17686150028706996No Hit
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GACTACAGGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2560.16894232863242506No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2540.16762246668998423No Hit
GANTACTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2470.16300294989144135No Hit
GANTANACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2470.16300294989144135No Hit
GACTANAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2360.15574370920801683No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2340.15442384726557604No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTCA2270.14980433046703315No Hit
GANTACACGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2250.14848446852459232No Hit
GACTANACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2190.14452488269726987No Hit
GANTANACGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2170.14320502075482905No Hit
GANTANTAGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2140.1412252278411678No Hit
GANTANAGGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2100.13858550395628616No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2080.13726564201384533No Hit
GACTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA2030.1339659871577433No Hit
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GANTANTAGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1980.13066633230164124No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCAGTAGGAGTTGTCTTCATATGAGGAAGAG1960.12934647035920044No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCATCAG1930.1273666774455392No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1920.1267067464743188No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTTAATGTTGTGGACTTGTAATTTGTTGGC1910.12604681550309838No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1890.12472695356065756No Hit
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GANTANTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1820.12010743676211467No Hit
GANTACTCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1810.11944750579089428No Hit
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GACTACACGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1740.11482798899235142No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1700.11218826510746976No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGCTTGGAAGCCTCAAGTAGCAGTAGATT1700.11218826510746976No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGATCTAGTGCTGTGGGGTTCATTCTGCC1680.11086840316502894No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTCA1680.11086840316502894No Hit
GACTANTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1660.10954854122258813No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAG1640.10822867928014729No Hit
GANTACCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1630.10756874830892688No Hit
GACTANCCGGGTATCTAATCNCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1610.10624888636648606No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCATCAG1600.10558895539526565No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCAA1540.10162936956794319No Hit
GANTANCCGGGTATCTAATNCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1530.10096943859672278No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTCA1530.10096943859672278No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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