FastQCFastQC Report
Tue 7 May 2024
EGAF00004969319

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004969319
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences61314
Total Bases14.6 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length239
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA9421.53635385067032No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA8131.3259614443683334No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA7091.1563427602178948No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA6631.0813191114590468No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA6441.0503310826238705No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA6201.0111883093583847No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA6130.9997716671559513No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA6060.988355024953518No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA5770.9410575072577224No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA5770.9410575072577224No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA5660.9231170695110416No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA5560.9068075806504224No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA5500.897021887334051No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA5470.8921290406758653No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA5070.8268910852333888No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA5040.821998238575203No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4960.8089506474867078No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4790.7812245164236553No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4700.7665459764490982No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4650.7583912320187886No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA4640.7567602831327266No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA4610.7518674364745409No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA4600.750236487588479No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA4560.7437126920442313No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA4480.730665100955736No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA4420.7208794076393645No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4390.7159865609811789No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4350.7094627654369312No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA4270.6964151743484359No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA4260.694784225462374No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA4240.6915223276902501No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA4210.6866294810320644No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4170.6801056854878168No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4170.6801056854878168No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA4110.6703199921714453No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA4110.6703199921714453No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA4110.6703199921714453No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA4100.6686890432853835No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA4070.6637961966271977No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA4040.6589033499690119No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA4010.6540105033108262No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA4000.6523795544247644No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3980.6491176566526405No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA3830.6246534233617118No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3750.6116058322732165No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3710.6050820367289689No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA3670.5985582411847212No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3660.5969272922986594No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA3660.5969272922986594No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA3630.5920344456404736No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA3580.5838797012101641No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA3580.5838797012101641No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA3570.5822487523241022No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA3560.5806178034380403No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA3500.5708321101216688No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA3450.5626773656913592No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA3410.5561535701471115No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA3410.5561535701471115No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3410.5561535701471115No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA3410.5561535701471115No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA3400.5545226212610497No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3380.5512607234889259No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA3370.549629774602864No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3370.549629774602864No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA3360.547998825716802No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA3340.5447369279446782No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA3310.5398440812864924No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3290.5365821835143687No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA3250.5300583879701211No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA3240.5284274390840591No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA3240.5284274390840591No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA3240.5284274390840591No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA3220.5251655413119353No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA3190.5202726946537496No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA3190.5202726946537496No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA3190.5202726946537496No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA3080.5023322569070686No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA3070.5007013080210067No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA3040.49580846136282086No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3020.4925465635906971No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA3010.49091561470463513No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2990.4876537169325113No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2960.48276087027432557No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2950.4811299213882637No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2930.4778680236161399No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2920.476237074730078No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2920.476237074730078No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2920.476237074730078No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2880.46971327918583033No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2880.46971327918583033No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2840.46318948364158263No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2830.4615585347555208No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2790.4550347392112731No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2760.45014189255308745No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2750.4485109436670255No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2740.4468799947809635No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2720.44361809700883975No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2700.44035619923671593No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2690.43872525035065396No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2670.4354633525785302No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2660.43383240369246834No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2650.43220145480640637No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2620.42730860814822064No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2610.4256776592621587No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2590.42241576149003485No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2550.41589196594578726No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2530.41263006817366343No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2530.41263006817366343No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTACCTCA2510.4093681704015396No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2460.4012134259712301No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2370.38653488599667285No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2350.3832729882245491No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2310.3767491926803014No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2300.3751182437942395No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2290.37348729490817756No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2230.3637016015918061No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2220.3620706527057442No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2210.36043970381968227No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2210.36043970381968227No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2200.3588087549336204No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2200.3588087549336204No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA2170.3539159082754346No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2140.34902306161724894No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA2130.347392112731187No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA2080.3392373683008775No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2060.33597547052875365No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA2060.33597547052875365No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA2030.3310826238705679No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA1970.3212969305541964No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA1960.31966598166813454No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA1940.3164040838960107No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA1940.3164040838960107No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA1890.30824933946570116No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA1670.2723684639723391No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA1670.2723684639723391No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA1670.2723684639723391No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTAA1650.2691065662002153No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA1630.26584466842809146No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGTGCTTAA1620.26421371954202955No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA1580.2576899239977819No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGCACATCA1560.2544280262256581No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA1420.23159474182079132No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCA1220.19897576409955314No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGTGCCTCA1120.182666275238934No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1110.1810353263528721No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA1100.1794043774668102No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA920.1500472975176958No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA850.13863065531526242No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA830.1353687575431386No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA800.13047591088495286No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA790.12884496199889095No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA760.12395211534070522No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCTTCA710.11579737091039566No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGATCCCCACGCTTTCGTGCTTCA700.11416642202433376No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA690.11253547313827186No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTCGATACCCGCACCTTCGAGCCTCA650.1060116775940242No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGATACCCACACTTTCGAGCCTCA620.10111883093583847No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph