FastQCFastQC Report
Wed 8 May 2024
EGAF00004969335

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004969335
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences95775
Total Bases22.8 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length239
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC46504.85512920908379No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC40064.182719916470895No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC36193.7786478726181154No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC32223.364134690681284No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC30943.230488123205429No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC30593.1939441399112507No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC27652.8869746802401464No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC26572.774210388932394No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC26092.724092926128948No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC24482.555990602975724No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC23642.4682850430696948No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC22452.3440354998694857No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC20182.1070216653615246No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC18871.970242756460454No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC18041.8835813103628296No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC17741.8522578961106761No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC17711.8491255546854608No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC16721.7457582876533544No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC15241.5912294440093968No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC14281.4909945184025057No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC13771.4377447141738449No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC13401.3991125032628555No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC11911.2435395458104932No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC10031.0472461498303316No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC5330.5565126598799269No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC4370.45627773427303575No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC4120.43017488906290785No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC3900.40720438527799535No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA3870.40407204385277995No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC3640.38005742625946226No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC3350.3497781258157139No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC3220.3362046463064474No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC3210.3351605324980423No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2980.31114591490472465No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2950.30801357347950925No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2910.3038371182458888No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2830.29548420777864787No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2570.26833724876011483No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2540.2652049073348995No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2500.261028452101279No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2480.2589402244844688No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA2480.2589402244844688No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2420.2526755416340381No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2390.24954320020882276No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2380.24849908640041768No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2360.2464108587836074No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA2170.22657269642391023No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA2120.22135212738188462No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2110.2203080135734795No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA2100.2192638997650744No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2060.21508744453145393No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC2060.21508744453145393No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA2050.21404333072304882No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1980.206734534064213No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1970.2056904202558079No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1960.20464630644740278No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1900.19838162359697206No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1860.1942051683633516No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1850.19316105455494648No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1830.19107282693813624No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1790.1868963717045158No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1750.18271991647089533No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1750.18271991647089533No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1750.18271991647089533No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1730.1806316888540851No Hit
GGACTACGGGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1690.17645523362046464No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1690.17645523362046464No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTTACCGCGGCTGC1670.1743670060036544No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1650.17227877838684416No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1620.16914643696162882No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1590.16601409553641347No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1580.16496998172800836No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1570.16392586791960323No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1530.15974941268598275No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1520.15870529887757764No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1490.15557295745236233No Hit
GGACTACGAGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1490.15557295745236233No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1480.1545288436439572No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1470.1534847298355521No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1450.15139650221874185No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1440.1503523884103367No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1440.1503523884103367No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCCGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1410.1472200469851214No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1380.14408770555990602No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1360.14199947794309578No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1330.13886713651788044No Hit
GGACTACGGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1310.13677890890107022No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCCCGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1310.13677890890107022No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1280.13364656747585488No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTTACCGCGGCGGC1250.1305142260506395No Hit
GGACTACGCGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1220.12738188462542419No Hit
GGACTACGCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1200.12529365700861395No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1170.1221613155833986No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTCGCTATTGTGTGTTC1140.11902897415818324No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1140.11902897415818324No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1120.116940746541373No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1120.116940746541373No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1110.1158966327329679No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1110.1158966327329679No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCA1100.11485251892456277No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA1090.11380840511615767No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1080.11276429130775253No Hit
GGACTACGAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1060.11067606369094231No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCCGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1010.10545549464891672No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1010.10545549464891672No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCCGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1000.10441138084051162No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.12.1)