FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00004969335

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004969335
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences95775
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length239
%GC45

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCCGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1010.10545549464891672No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCA1010.10545549464891672No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCCGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1000.10441138084051162No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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