FastQCFastQC Report
Tue 7 May 2024
EGAF00004969539

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004969539
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
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Total Bases2.3 Mbp
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Sequence length239
%GC52

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Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

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N content graph

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Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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