FastQCFastQC Report
Tue 7 May 2024
EGAF00004969547

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004969547
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences27272
Total Bases6.5 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length239
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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[WARN]Adapter Content

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