FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00004970929

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00004970929
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length146-16442
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGTAACTGAAAATGCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTCATGCT22.666666666666667No Hit
TTGAAGAGGTGACAAACAAAGGAGTATCAACGATCTTCCCAAGGTCTGAC11.3333333333333335No Hit
GGTATGCTTCGTTCAGTTGCATTATTGCCATCAGATTGTGTTTGTTAGTC11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAAGTGACCAAAACAAGGAAATGCAGAGGGCCTTGGCCTCATAGA11.3333333333333335No Hit
GTTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTGAGAAAAGATGAAGTCTCAAAG11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGTTCTCTAGTGGCAGACGGCAGCTGTCTGAGTTCATG11.3333333333333335No Hit
CGTGTACTTCGTTCAGTTGCATGTTGCTAAATTAACCTTTCTGTTGGTGC11.3333333333333335No Hit
CGGTATTACTTCGTTCCAGATTGTATTGCTGGTGCTGGATGTAGAGGTAC11.3333333333333335No Hit
TTAAAGAGAGGTACAAAACAAAGGGGAGTATCCAACAATCTTCCCAAGGT11.3333333333333335No Hit
TTGAAGGTGACAAAACAAGGGAGTATCCAGCAATCTTCCCAAGGTCCTGA11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAACAAGGGAGTATCCAACAATCTTCCCAAGGTC11.3333333333333335No Hit
TTGCTTGAAGAAATTTGACTGACGAAAAACAATTATCCATCTTCCCCAAG11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTAAGGCAGACCTTCTGGTCTTATCTGCTGTTACTG11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCTGATTCATGCTCT11.3333333333333335No Hit
CAGTATGCTTCGTTCAGTTACATATTGCTGGTGCTGTAGCTGACTGTCTT11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAACAAAGGAAATGCAGAGAGAGACCTTGACATA11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGGAGTGACAAAACAGAGGGAGTATCAACAATCTTCCAAGATCA11.3333333333333335No Hit
CAAGTATTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTGAGCTGAAGATTGCACCAT11.3333333333333335No Hit
CATTGTACTTCATTTCAGTTACGTATTGCTGATACCCTCTAAATCTGTGA11.3333333333333335No Hit
ACAGAAGAGGTGACAAAACAAAGTATCCAACAATCTTCCCAGGTCTGACA11.3333333333333335No Hit
CAGTGTACTTCGTTTCAGTTACATGTGTTGCTGGTACTGAACAGGTGCTG11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAAACAAAGGGTATCAACAATCTTCCAAGGTCCT11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGAAGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTCATG11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAACAAAGGAGTATCAACAATCTTCCAGGTCCTG11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAACAAAGGGAGTATCCAGCAATCTTCCCAAGGT11.3333333333333335No Hit
CATGTGCACCCGTTCCAGTTACGTATTGCTGGGTGCTGTAGGCAGTCCTG11.3333333333333335No Hit
AGTAACTAGAAAATGCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCACGAGTTCATGCT11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAAATTTGACAAAACAAAGGGAAATACAGAGGAGACCTTGACATA11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGGTGAGAAACAAAACAAAGGAGTATCCAACAATCTTCCAAGGT11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGTCTGATGGCAGACAGCTGTCACAGGGGGATTTAGTA11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAGAAAATGCTTCCTGAGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTCA11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCACGGTTCATACT11.3333333333333335No Hit
TGCTGAAAATGCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCTGAGTTATATACTCTGC11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTCATGCT11.3333333333333335No Hit
GTATGCTTCGTTCAATTTACTATTGCTGGTGCTACAGACTTGGTACGGTT11.3333333333333335No Hit
CATTGTACTTCAGTTCAGTTGCATGCTGGCGTTGCTGAGTCTTGTGTCCA11.3333333333333335No Hit
AGTGTTTGAAAATGCTTAGTGGCAGGCTTGGCTGTCTGATTCATGCTCAC11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTCATGC11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGGGTGGCAGAAACGAGGGTATCAACAATCTTCCCAAGGTGGCA11.3333333333333335No Hit
AGTAACTAGAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCCTGAGTTCATGC11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAACAAGGAGTATCAACAATCTTCCCAAGGTCTG11.3333333333333335No Hit
GTAACTGAAAATGCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCTGAGTTCATGCTGCT11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTTATCTT11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCACAGTTCATGCTCT11.3333333333333335No Hit
CTGGTATACTTCGTTTCAGTTACGTGTGCTCATCAACCCTGGACTTACAA11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAACAAAGGGAGTATCCAACAATCTTCCCAAGGT11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAAGTGACAAAACAGAGAGTATCAACAATCTTCCCAAGGTCTG11.3333333333333335No Hit
CTTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTGGTGCTGAACGAGTCTCTTCAG11.3333333333333335No Hit
CAGTGCCATGTTCGTTACGTATTGCTTAGCTGGGCATGATGGCACGTGTC11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGTGACAGCTGGAGTATCCTTAATCTTCTAAAGTCCTGACAA11.3333333333333335No Hit
GTTGTACTTCGTTCAGTTTTATATTGCTGGTGCTGCACCCACGCTTACTT11.3333333333333335No Hit
CAGAAGAGGTGACAAAACAAAGTATCCCAACAATCTTCCCAAGGTCCTAA11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGGTAGACAGCTGTGCAGAGAGTTCTTACTCT11.3333333333333335No Hit
AGTAGCTGAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCTGAGTTAAATGCT11.3333333333333335No Hit
CATTGTACTTCGTTCAGTTACATGTTGCTGGTGCTGCACCCACACTTACT11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCTGAGTTCATGCTC11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACCAAAACAAGGAGTATCAACAATCTTCCCAAAGGTC11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTGTCACAGTTCATGC11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGGTGACAAAAACAAGGGAGTATCAACAATCTTCCCAAGGTCCT11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTGGTGGCAGACAGCTGTCTGAGTTCATGCTTT11.3333333333333335No Hit
TTGAAGGGTGACAAAACAAGGGAGTATCAACAATCTTCCCAAGGTCTGAC11.3333333333333335No Hit
TTGAAGGAGTGACAAAACAGGGGGTATCCAGCAATCTTCCCAGGAGTCTG11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAATGCTCTAGTGGCAGACAGCTGTCTGAGTTCATGCTTTCT11.3333333333333335No Hit
GTGGCTTTGAAAATGCTTCTGAGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTCATG11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGAGGTGACAAAGCAAAGGGAGTATCCAACCGTCTTCCCAAGGT11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCACAGGATCATGCTC11.3333333333333335No Hit
CATTTTTAGCTGGTTCAGTTACGTATTTATTTCAAACTATTCCCTCAAAA11.3333333333333335No Hit
TTGAAGAGATGACAAAACAAAGGAGTATCAGTAGCAATCTTCAGGTCCTG11.3333333333333335No Hit
GTTATTATTCGTTCAGATTTTGTATTGCTGGTGCACCATGGCTGACTATC11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGTCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCACAGAGTTCATACTCTCTG11.3333333333333335No Hit
CAGTATGCGTTCGGTTACATGTTGCTGTGCTGTAGCTGACTGTCTTCCAT11.3333333333333335No Hit
TTTGAAGAGGTGACAAAACAAAGGGAAATGCAGAGGAGACCTTGACATAA11.3333333333333335No Hit
AGTAACTGAAAATGCTTCTAGTGGCAGACAGCTGTCACGAGTTCATACTC11.3333333333333335No Hit
GTTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTGGTGCTGGATACTTAGAGGAAT11.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)