FastQCFastQC Report
Wed 11 May 2022
EGAF00005304910

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005304910
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences40832667
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC32

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[OK]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT3112820.7623357053802046No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA1840080.45063919043054423No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT1196450.2930129447581761No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT1101460.2697497079972758No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC1037990.2542057808763753No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA800170.19596319779944818No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGAT725190.17760044916977868No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAATTTGAT674370.1651545317870126No Hit
CGGGAGGCGGAGTTTGTAGTGAGTCGAGATTACGTCGTTGTATTTTAGTT572770.14027249309970372No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTCGAT571880.14005453035923418No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT525820.12877434628504672No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGAGTGTAATGGAA504200.12347956600532609No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAATGGAA494030.12098891311703935No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGAGTGTAA473830.11604189361424763No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAA470470.11521902304348623No Hit
CGGAACGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGATTGTAATGGAA450130.11023771726691278No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA424490.10395843112574547No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT420210.10291025075584703No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)