FastQCFastQC Report
Wed 27 Apr 2022
EGAF00005307953

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005307953
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length186-251
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCTACGGGGGGCTGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAT36.25No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGCGCAAGCCTGAT24.166666666666666No Hit
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGCGCAAGCCTGAT24.166666666666666No Hit
CCTACGGGTGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGCAACCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTAGGGAATCTTGGGCAATGGACGGAAGTCTGAA12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCTGCAGTGGGGAATATTGGGCAATGGGGGCAACCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGAGGCTGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGGGGAACCCTGAT12.083333333333333No Hit
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGGG12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGACGGGCAGACTAGAGTGCAGTAGGGGAG12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATCTTGGACAATGGGCGAAAGCCCGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAACTCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGACCAAGAGTTTGA12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTAGGGAGTCTTCGGCAATGGGGGCAACCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGCGCAAGTCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGCGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGGAAGTCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGAGGCTGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGCAAGTCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGGGCAACCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCTGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGCGAAACCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGCGGCTGCAGTAGGGAATATTCGTCAATGGGCGGAAGCCTGAA12.083333333333333No Hit
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGGATATTGCACAATGGAGGAAAGTCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCTGCAGTGGGGAATATTGGTCAATGGGCGCAAGTCTGAA12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATTTTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGCGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGACCAAGAGTCTGA12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGCGGCTGCAGTGGGGAATTTTCGACAATGGACGCAAGTCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCTGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGCGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCAGCAGTAGGGAATCTTCGGCAATGGACGGAAGTCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTAGGGAATATTCCACAATGGACGCAAGCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCTGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGGCGCAAGTCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTGGGGAATTTTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTGGGGAATATTGGGCAATGGACGGAAGCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTAGGGAATCTTCGACAATGGACGCAAGTCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCTGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGTGGCTGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGCAAGCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGCGGCTGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCCTGAC12.083333333333333No Hit
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGGGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGACAATGGGCGCAAGCCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGGACAATGGAGGGAACTCTGAT12.083333333333333No Hit
CCTACGGGAGGCTGCAGTGGGGAATATTGCGCAATGGGGGGAACCCTGAC12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)