FastQCFastQC Report
Sat 23 Apr 2022
EGAF00005307954

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005307954
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length250-251
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAGCATGAA24.166666666666666No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGGTCATGAA12.083333333333333No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAGCCTGAA12.083333333333333No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGCGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGCGCTTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGTATCTACTCCTGATTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTGAG12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGCGCATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGGATCTAATCCTGTTTTCTACCCACGCTTTCGAGCATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAGCATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCATGCTTTCGCACCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAGCATCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTACCCTCGCTTTCGCGCATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACTAGTGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCATGCTTTCGCTCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCATCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGCATCTAATCCGGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAACCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCTAGCTTTCGAACCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACACCTTCGAGCTTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACGAGGGTCTCTCCTTCTGTTTGCTCCACCCGATTTCGCACCTGAG12.083333333333333No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCCATTCGCTACCCTCACTTTCGTGTCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACATCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCAAGCTTTCGCCCATCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCTGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTGAA12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGCACCCCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGCGTCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCGCACCTTCGAGCTTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGGGCATGAA12.083333333333333No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCCGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGAGCATGAA12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGATTCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGGGCCTGAG12.083333333333333No Hit
GACTACAGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACTGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTACCCATGCTTTCGCGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCATGAG12.083333333333333No Hit
GACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGATACCCACGCTTTCGAGCATGAA12.083333333333333No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCATGCTTTCGAGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCGGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCACGCTTTCGCTTATCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACCAGGGTATCTACTCCTGTTCGCTCCCCATGCTTTCGCTTCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCTGTTCGCTCCCCATGCTTTCGCTTCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACAGGGGTATCTAAGCCTGTTTGCTACCCACGCTTTCGGGCCTCAG12.083333333333333No Hit
GACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCAA12.083333333333333No Hit
GACTACTCGGGTATCTAATCCCGTTCGCTCCCCATGCTTTCGCATCTCAG12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)