FastQCFastQC Report
Wed 27 Apr 2022
EGAF00005411767

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005411767
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences75
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length61
%GC36

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCAAAATCCTCATTTAAACAATAAATTAAATGCAAAAATAAATCCACTTCTTTTACTTCCT11.3333333333333335No Hit
CATCAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATAATAATAATAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
GCTCACAGCTGATCCTAAGGTTGAAGCCATCCTTGTCAATATTTTTGGTGGTATCGTCAAC11.3333333333333335No Hit
TAATTCAACTGTCATACCATCTAGTGGAACCTGAGAAAAGGTGCAACTCCTGGGTGGCACA11.3333333333333335No Hit
AAACCAGAAAGATCATGAACTAAAATAAAACTCGAGAATTGAAGTCATTGTGGAAGCTATA11.3333333333333335No Hit
GATTAGATCCCCTGGGCAGAGAATAAGATGTATATAATTTATTTCATTTAACACAGCCTAG11.3333333333333335No Hit
CTGCTGGGTTGCAGCCTATGCCATGAGAGGGTACTGGAAGCAGGAGGGAGCCCTGGCTAGG11.3333333333333335No Hit
GATATACTCATTCTGGCATAACATAAAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
GGTGGGGTGGGTGCGGGTGGGGTGGGGGGGGGGGGAGTCCGGTGTGGGGGGGGGGGCGGGG11.3333333333333335No Hit
GTATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
GTCAGGCCTCTGAGCCCAAGCTAACCCATCATATCCCCAGTGACCTGCAAGTACACACTCT11.3333333333333335No Hit
GAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATCAACCCGAGTGCAATGGAATGGAGTGGAATGG11.3333333333333335No Hit
GGGAAGCGTCGGGTGTGGTGTGGTGGTGTGTGTTTGGTGGTGTTTGTGTGGGGGGGGTGGG11.3333333333333335No Hit
GTGGTATCAACGCAGAGTCGAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTGAAGT11.3333333333333335No Hit
GTATAAACCAATTAACTATCAACACTACCAAACAATTTAATTGATAAATAGACAATTCATA11.3333333333333335No Hit
CTTCCAGGTCTTATTCTTGATTACGACAGGGAATGAGTAGAGCAGATCATCAGGAACACCA11.3333333333333335No Hit
CTACTTACTTTTCAATCTCAGGAAGAAAAATGCTAGAAGGAGGCACATGGACAAGGCGCTG11.3333333333333335No Hit
ATTGATCCACGTCGAATAAAGAGCATACAAGAGTAAAACGGTATTCAGGTAGTAATCAAGG11.3333333333333335No Hit
GGCACCGGAGGATGCCCGGCCCGGCCCCCCCCCCGGGGGGGGGTTTTTTTACAAATAAAAG11.3333333333333335No Hit
GCCACTGAACCTTGATGGGACCCCATTTTGCAAACTGGATGCATCATACATCCTGTCTCTT11.3333333333333335No Hit
GTATAAGACGAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATAAAA11.3333333333333335No Hit
GGGCCGGGCGTGTGATGGGTGGTGTATTGAGTTTTGGTAAAATAACGAGGGGGTCTGGGTG11.3333333333333335No Hit
GTCTGAGCTTGTCCGGCGAGGGTGGGAGTTGGTCCCGGCGGAGATCCAGTGGGAAGCTGTC11.3333333333333335No Hit
GAAATACGCATTCTGACAGTACATAATGCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
GATCTGAAGTATTACTGTAACCTCGACTATAATAACCAGGACCAAATATAGCCAGATATGA11.3333333333333335No Hit
GACGGGAGTGGGACGGACGGGATTGGGGGGGGGTGGAATGGTAGGGTGGGGAGGGGGGGGG11.3333333333333335No Hit
GTACAAAATACAAGAATATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
ACAGCTGGTATCAACGCAGCGTACGGGATGGCACATGCAGCGCAAGTAGGTCTACAAGACG11.3333333333333335No Hit
GAGGCTATCCAGCGTACTCCAAAGATTCAGGTTTACTCACGTCATCCAGCAGAGAATGGCA11.3333333333333335No Hit
CTCTCATACAGTTCATTTTGGGTTGGGAAGGGGGCTTACAATCACTCTAAAGGTATGTTTA11.3333333333333335No Hit
GTATCAACGCAGAGTCGAGGTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGTTTTTTTTGGGGGGGGG11.3333333333333335No Hit
CTTTAGAGAAGTGTGAAAATAATGTGAACTTAGGCAGTATTATAGAAAGAAAAAATAGCAA11.3333333333333335No Hit
GTTTACGCCCTAGATGGTGTAGCACTACCGCAAAATAATGCAGACTCTATTAAAGGTTCGT11.3333333333333335No Hit
ATAAAAACTGAGTCAGTGCATACTGAACCCAGTAACATTTGTCAACAGTTACGACAAGTCT11.3333333333333335No Hit
GGATAACACATGTGACGCGGCCGCCGAAAAGGATAGTGATTATTGCAGTCCTCGTGGTCTA11.3333333333333335No Hit
ATTGATAACCTTGTTTTGCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
GTACGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTAAAAAAGTGATTTAAAATGAAG11.3333333333333335No Hit
ATATACTCAATGTAGAAGTAAATCAAGCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
CAATGTCGGATGGATGAAACCCAGACCCATAGCAATTCAGGTAATTTGACTTTCCATTATC11.3333333333333335No Hit
ACGCAGAGTCGAGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGGGGGGGGGG11.3333333333333335No Hit
ATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATTAAAAAAAAAAATA11.3333333333333335No Hit
GTCTTGGAGCAAACTGCTACTATGGCATGGGACTGTCTATTGACAGTCTATTATACACAGA11.3333333333333335No Hit
GAACGGACTTCCATCAACAAAACTCAATAATTTGCAATAGCCCGATACCTTGATCTACTAA11.3333333333333335No Hit
GATAAAAGCCTCTGTTACGCACACTTAAATAATAAAACCTTCTATAGCCTCTGTTGTGACC11.3333333333333335No Hit
GTACGACCCAGATATACGCATTGTGGCAGTACATCAATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
CACAATGTACCTCACCAAGTTTGGTGAGAAGATAAATGGCACAGAACCTGAAGATGTCATC11.3333333333333335No Hit
CATTGAAGGAGTGCTCCATGAAGACTGAAATAGATTCCCTCTCACAAGCTGCATTAACGTA11.3333333333333335No Hit
GCGTTACGATGTGCGTCTCCAGCTCATACGCTCCGGATACATGACACATAAACACCGCTGA11.3333333333333335No Hit
GAATAATCCATTCTATGTAGCCATGTAACTATGAATAACTATTTCTTAAATATTTAACCAT11.3333333333333335No Hit
CTCTCAACTAAACTTCATCGCTAAAAACCCAAAAAAAAATAAAAAAACAAAAACTACTGGG11.3333333333333335No Hit
CTCAAAAGGTAGAGGTGTACTAAAGAAATAAAGCAAAATATGGAAATTCTAATTTGCAACA11.3333333333333335No Hit
GAATTCAACGACGTGAGATAGGTCAACAAGGACCCGTGGTACGCCATAGAAGAAATCAACA11.3333333333333335No Hit
AATAACAACAAGCCGACACACAAAAACTTGAATCTATATGAAAAACATGTTTTTTTTATAA11.3333333333333335No Hit
ACGATGTCATCTGACAGAGTGACTATGATATATCCCTGTTACTATTTGATGACATTCAATA11.3333333333333335No Hit
ATTACACACAACATTACTGCATGTAAAAGAAACACAATACATCATTCACTAATACAAAACT11.3333333333333335No Hit
ACTGAATACTTCTCTGTTTTTTATGTTTCCCTGAAGATTGAGATGTATCTTATACAAATCT11.3333333333333335No Hit
CTAAATGCTGATCATCTGAGCGAGCTGTCTTCAGGGATACCTAAGGAATCTTCAGAGCTAA11.3333333333333335No Hit
GAGCTACTCATCTCCTTATTCGCAACACTCAACAAGGGCTTAGGTGGGCTCTACCTGGCTA11.3333333333333335No Hit
GAGTACGGGTAAGCAGTGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAACCTTAAAA11.3333333333333335No Hit
CTCATATCAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAAAAAAAT11.3333333333333335No Hit
CCTGACTTCCCATAACAACCTTGCTACTCCACACAGTAAATATAAAATGGAAACCTGATAC11.3333333333333335No Hit
GTGCAGGCCATGGGTTACTCCTTCCCCTTCACAGACGCAAAGGGCTACCAGAACCACATGG11.3333333333333335No Hit
GCCGGAGGGTGAGGCCGCGGCGGTCGATGGGGGGCGCCTCTGGCCACGGGGGGTTGAGCCG11.3333333333333335No Hit
GTACGGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAATATTAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
ATATCAAAGAAAAGTACGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
TATCAAAATCTCACGCTGCCAAAAAATTATTAGTTCTTGATATCGGTCCTCTGATATTGAA11.3333333333333335No Hit
ACATGCAGTACATCAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTCAAA11.3333333333333335No Hit
CTTGAATACACGAATACAACCCCATCTAAACAAAAGCTGCAACACACACACAACAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
CATTGTAGCAATACATCAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAA11.3333333333333335No Hit
GATATAACCCTGCCCAAGAGCTACCGGACTAAGCTATAATATGTCTCATTAACAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit
GGTTCATTCCAATCCATTCCTTACCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTTCATACGA11.3333333333333335No Hit
AGCAACAACTAGCCCTACATAATAATTACGAGTAGTTTATAAATCTGGACACAATATCCAT11.3333333333333335No Hit
GCAGAGGAAGGGACACAACTAACCTCCTCGGACTCCTGACTAACTAATTTAGAAAAATGTC11.3333333333333335No Hit
CTAATACAAATATGAACCTGACGACGATCTAACGCTTATAGATCTAGATCCACGCAGAATC11.3333333333333335No Hit
TTATAAACCCAGAGTACGAGATACAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)