FastQCFastQC Report
Wed 27 Apr 2022
EGAF00005414196

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005414196
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length91
%GC34

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTGGTATCAACGCAGAGTCGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT22.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTCGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT22.083333333333333No Hit
CCCTACTCTGTGAACTCCTAGGTTAAGTACCAATCATAGCCAATTCATTT11.0416666666666665No Hit
CGCCCCTGCTGCTCGAAACGACTGCCAAGAAAAATAACAACTGGCAAGCC11.0416666666666665No Hit
TTGTGGGCCAGCCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAG11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTCGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGT11.0416666666666665No Hit
CACAAAGTGGTGGGAAAATTACCACTAAAATTAATAGTGAAAAAAAAAAT11.0416666666666665No Hit
AAACTATAATAAAAGAATACACAAAGAAAAAAACACCATAAAACATAAAA11.0416666666666665No Hit
GAGTACGGCAAACCACCAGAGACTCATACGGAGGAGCCTGTAGGAGCCCA11.0416666666666665No Hit
ATTTATTTTTGGTGTTATTTTTGATTTTGTTTATGTGTTGTTATTTTTAT11.0416666666666665No Hit
CTAACAACTCAGAGTCGACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA11.0416666666666665No Hit
CCCAAAAGAATCAGTATTTTTTTTATTAATAATTAATCTTAAAATATGGC11.0416666666666665No Hit
CAGTTGTAACAAAGAATACTTTATTTTTTTTATTTTTATTTTTATATTAT11.0416666666666665No Hit
ACGCAGAGTCGACTATATTTATTTTTTAATTATTTTTTTTTATTTGGGAT11.0416666666666665No Hit
GAGTTACGTGGGGAAATGTCCAGCATTCACCCTTCCGAGAACAACAGGCC11.0416666666666665No Hit
AAACAATATATATGAAGCATAAAAAAATCTTAACAAATTAAATTACTACT11.0416666666666665No Hit
GTCGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATAGGCCGGGG11.0416666666666665No Hit
ATAGAAAACTGCAAACTTGCTCTAACTGCTATTACTAGAATGACTAGCCA11.0416666666666665No Hit
GTTATTGCGTTTATTTTGCTTGTCTTTTGGGTGATTTTTTGTTTTATTTT11.0416666666666665No Hit
GTTGTCCAGGTGAAAGGCAGTAGGCATGCATCTTAGGCAAATCCGTGGAG11.0416666666666665No Hit
ACGTAATAGCCTGCGATAAGCTTCGTTGAGGCGGCAAATATCCTGTGATC11.0416666666666665No Hit
AAGCAGATTCCAAAAAATAAAATTAAAATAAATATTAATGTGCTGGAGAT11.0416666666666665No Hit
CAGGACATGCCCATCATTCCCTTCCCCTGATGGATGCAGGATGTGACCAT11.0416666666666665No Hit
GCCAAATACAAATGAGTTAAGTAAAACTCAAGAAACGCTCTTTTGCTTAA11.0416666666666665No Hit
AATTCTGTTGCTGGAAAAAGTCTGAAAAACTTGTCTTTACGGCGATTGAA11.0416666666666665No Hit
GCTTGTCAGGGCCTTAGCAGCTTCTAGGAAAACACTGTAACTAATATGCC11.0416666666666665No Hit
GTTCCATTGCAAGCGAAAGTTGTGGATCATTGATACCAATTGCACTTAAC11.0416666666666665No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACGGGAGGAAAACGAAAAAACAAAAACCTAACAC11.0416666666666665No Hit
GTGCTGGAGCAGGGACCATCCTCTCACTACTACACCACCCTGGTCACCCT11.0416666666666665No Hit
GGCCGGGGGTGGCCCGTCCTAAAGTAGCTGCCGGAAGACGCGGCACGAAA11.0416666666666665No Hit
ACTTAGAAGAGTAGCATGAGGAAGGAAAAGATAAAAGGTTTCTAAAACAT11.0416666666666665No Hit
AACCCCGTCAACGCAGCAACACCTGAAGAAGGTCTATGCAAGTTTTGCCC11.0416666666666665No Hit
ATAACAAGAAAATGTGTGAGATAATAGAAAAACATAGTGAGGATGAAGAA11.0416666666666665No Hit
TACATACATTCCGAACTCAACAAAAAATAAGAATAACAGAAGACACAATC11.0416666666666665No Hit
CATCCTGAACGTGCTTATACACGTGCCCAGCTACTTGAGCAGGTCTCGGG11.0416666666666665No Hit
TCTAAGTGTAATATTAAAGAATTATGCCTGTGACTAAGACATGGTTTCTG11.0416666666666665No Hit
GGCCTGGCCCGGCTCACATTAGTCAGTGACGCCAACCCTCCTGCGTGCTG11.0416666666666665No Hit
GAGCATGCTGACTAAACATACTTCAAACACAGCAGAAGGTAAAGAGTCTG11.0416666666666665No Hit
AAATAATACAGGGAAAAAGCAATTACATTTAAGAATTAGTAACAGTTTAC11.0416666666666665No Hit
GTTCTCAACCTGAAACATTAATTTATGCAGTGGTGACGGTTGTTATGGTT11.0416666666666665No Hit
ATTGTCTTCTGCCCAAGATCCTACTTTACAGCTTTGCAGTGATATTTTCT11.0416666666666665No Hit
ATATAATAGTTTTAATTAATATAACTTAAAATCCTTTTAATCATTTAATG11.0416666666666665No Hit
ATTAAAGACTCCTCTGCTTTGGACTGAATCACTTCAGGAGTTTGTTACCA11.0416666666666665No Hit
ATATTTTAAAATTATGACCAAAGGAGACTGAATTCAAATTAAATAGAAAT11.0416666666666665No Hit
ACCAAAACACCAATATATATAATATAATTATTTATTATATTTTTATTTAT11.0416666666666665No Hit
CACAAACACATAAAAATAGTATCATTCATTTTACTAATACCTCCCTCAAG11.0416666666666665No Hit
GTTCTATCAACGCAGAGTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT11.0416666666666665No Hit
GAGTCGACGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT11.0416666666666665No Hit
GGTTTGTACAATAGAATCGTAAAGAGAACCAGTAATAAGGTTTAACTTTT11.0416666666666665No Hit
CACAAGAGAATTAATAATTTATAAAATTATTTAAAATAATAAATTACCCA11.0416666666666665No Hit
ATACGGGCACAGAGTGTAAAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
ACGCAGAGTCGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTA11.0416666666666665No Hit
ATCTTGTATCAACCTGGACATTTTACATCCATAAAGTAAGAATTTGTACT11.0416666666666665No Hit
CATTTGGATTGGATGAATTCCAAATTCTGCTAGCTTGCTTTTTAAAATTG11.0416666666666665No Hit
GTGCCTGTAACTTCTGAGTTGAAAAGATCAAAAATGCCTACTTCAGTGGT11.0416666666666665No Hit
AAATCAACCAATACTATAAGTAAAATTATTTAATTTTAATTATAATTCGT11.0416666666666665No Hit
GTCGTATGGGTATGCCATTTCACTGGAGAGGTCCAGGGTCCAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
CATTTCAAAGATGGAGACTTGTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACACA11.0416666666666665No Hit
CGTTTATTCTCCATTTGTTAACTTGTTAATTTGTTTAGTTTATTATTTTT11.0416666666666665No Hit
CTCAACAAGGCCAACATCAAGCGATAAATCCTCCCTTATCGTGAGTTGCG11.0416666666666665No Hit
ATCGACATTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT11.0416666666666665No Hit
AATGCTGAAAGCTATTATTTAAATGGTTTGAAAGTGAATCAAAATGAGAA11.0416666666666665No Hit
GATCAGCACATTAAGTTATATGTGTTTTAGCGGAAAGCTCTGGGACTGTC11.0416666666666665No Hit
CACCTATACTACACAAGTAAGATCAAATTACAAAGTCAACATGAAGTAAA11.0416666666666665No Hit
GTAACAACTCAGAGTACGTTACATAAGTTTGAGTGAACAGATATTTTAAA11.0416666666666665No Hit
TACTAAAACTCTCATTTAAATAAAATAACAATACTCAAAAATAAAAGATA11.0416666666666665No Hit
AAACAAAAAAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAATAAAAAAAAAACCATA11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG11.0416666666666665No Hit
CCTTACACCAAAACCAAAAAAAAACAAGAACAAAAACTACAAAGATTAAA11.0416666666666665No Hit
GTACGGGCAATGCAGTGCATTTCACAGCATCAAGAAGAATTCCAACAAAC11.0416666666666665No Hit
CATATAGAAGTTCTCCTTATCCTTTGGACTTGCAATACACACAAAACTTT11.0416666666666665No Hit
CTTTTGTGGGGGTGGGTAGTCTTTTGAGTTTGGTGTTTTGTGTGTGTTGT11.0416666666666665No Hit
GTATAACACAGGAAGGTCGTGGATGACTACACTCAATTATACGGTAAAAT11.0416666666666665No Hit
TATACACATCTCCGAGCCCACGAGACCGTACTAGATGTCGTATGCCGTCT11.0416666666666665No Hit
TGAGAGTCAAACTAAAAAAAATTAAAAATAACAATAAACAAAAAAAAAGA11.0416666666666665No Hit
ACAGCAGAGATATATGCCTATCGAGAAGAACAGGATTTTGGAATTGAGAT11.0416666666666665No Hit
GAACAACACAGTGTAATAAAGGGAGCAAACATGCCAGCATAAAGCAGCAT11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTCGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT11.0416666666666665No Hit
ATACGATGGTTCGTAACACCCAACCAAAACCCAAAAACAACACCTGTCTC11.0416666666666665No Hit
GGGTTTCCCCATTCAGAAATCTCCGGATCACAGGATATTTGCCGCCTCCC11.0416666666666665No Hit
AACAACGCAGACTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTT11.0416666666666665No Hit
ATTAAAAACATCTCAGAGCAAACTAAACACTTACAGAGCTTTCTTCCCGA11.0416666666666665No Hit
TTGGAAAAGCAACATTTTCATAGACGGTCATGTCGGTAAATAACGCACCA11.0416666666666665No Hit
ATCAACGAAGAGTCGACTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT11.0416666666666665No Hit
GATCAGCTCACAACCCCGGAACCCCTGGTGTGTACGGGTCAGGCAGACAC11.0416666666666665No Hit
CATAAAAAGATTGAGGCTGGATGCTCACTCTGTGATCCCAGCACTTTGGG11.0416666666666665No Hit
CAGGGATTGGTGTAGCTGGATAAATTTTCATTATATTTTGTCATCAAATG11.0416666666666665No Hit
ATATAATACAACATAAAAAAAAAATATATAATAAAAATAATTAAAAATAA11.0416666666666665No Hit
GCCCTAGAGAAAAAGCATTAGGTTTAATGCGAGAGAAAGCACGCAAGATG11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTACGGGGATAATTAATTAAATATGAATAAAATAATG11.0416666666666665No Hit
GGACAAACGCTTAATTCTAACTATGAAAGATAGCATCTTATTTCTAACAA11.0416666666666665No Hit
CAGTGGTATCAACGCAGAGTCCACTTTTTTTATATTTTTTTTTTTTTTTT11.0416666666666665Clontech SMARTer II A Oligonucleotide (95% over 22bp)
ACCCAGAGTCGAAGTATATTTTAAATTTTTTAATATTAAAATACTTCTGT11.0416666666666665No Hit
GATACGACCTTAAATAATTTAATAATTATTTTTTATATGTCTCCAGCAGA11.0416666666666665No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph