FastQCFastQC Report
Sat 23 Apr 2022
EGAF00005414197

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005414197
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length61
%GC33

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACGCAGAGTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTT11.0416666666666665No Hit
AACTTGATCTGGAAAAGTCAAGAGAAGAGAGCAGAAAGCAGGCTCTTGCTGCTAAAAGACA11.0416666666666665No Hit
CTGCAGGAGCAGAGAGAGGCTTATGAGGTTTACCAGGGTGGTGTAGTAGTGAGAGGATCGT11.0416666666666665No Hit
ACAAAGCACCTCAAATTAAACAAAATAAAACCTAAATTAAAAATAAAAAAAACAAAAACAC11.0416666666666665No Hit
TTAAAAAATCAGAAAACCGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
AAGCAATCAACAAAAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAATCATAATCTAGTCCAGGATAG11.0416666666666665No Hit
TCAACGCAGAGTACGGGAATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAC11.0416666666666665No Hit
GATCACGGAGGAAGTAGGCAGAACTTCCAGGACCAGAACCTTGGTCCCAGGCTGCAATCAC11.0416666666666665No Hit
CCATCTGACTGATATCTTATCTAAAGGAATTTGAACCTTTTTCTTCCAATTGCTTTCACTT11.0416666666666665No Hit
CAAAAAAATAAAATAACATGCATAACTAAAAACTAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GAGAAGTACTCTTATATAGTCGAAAAAATAAATAAAGAAAACGACCTCGATCTGGCATAAG11.0416666666666665No Hit
TCCAGCAAGAAGTCCCAGTCTTTTCTGTTCAGTTTCATGGCTATGAGCTGTTGCCATCAGC11.0416666666666665No Hit
ATGAAGATTGTATTTCCCTCTATTTTACCATGCATAATTTCAGATATTAACTTTTTAAATC11.0416666666666665No Hit
CATACTGAGACCCCCGTCTCTATTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GAGTCATAATATTGGCTATAACACATTATTTGGCAAACACAAAATTAAAAATCAATCTGAG11.0416666666666665No Hit
CAGAACGTGGTAAAGAAATAAAGAGAATGTCGTGGATGCATTAGCAGTAAGAGGCGATGAA11.0416666666666665No Hit
CATAATAAATCTCATGTGCCAGAATATAAGATAAAAAAAGAATACAAAACATACTCAAGCC11.0416666666666665No Hit
GGAGCGCGGGGGTGGGGTCGGCTTGCCTGCGTTGAGTGGCAGTGGGCGGGTACGCTGGGTT11.0416666666666665No Hit
CCAAAGAACCATAACAAACGACACAAATTCATAAATTAATATTTCATGTAGAGAACCTGTC11.0416666666666665No Hit
GGGGGTGGGGGGGGGGGTCGGGGGCGGGTGGGGGGGCGAATGGGGGGGGCGGGGAGGGCGG11.0416666666666665No Hit
ATATTTCTGCATGCTTTGTTGAAGAAGTATTTGGTTTAATTCCAGGTTATCAGTTATGTTT11.0416666666666665No Hit
AGAATATTTAACCAAAAGAGCGTATCTTTAGTTTTACATAAATCATATGTATTATGAATGT11.0416666666666665No Hit
GGTATCAACGCAGAGTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGTGATAAG11.0416666666666665No Hit
ACCATATAAGTGTCTCTAGGCAATAAGGCAATACCTTCACCTGTGGTATTACTTAACTTTT11.0416666666666665No Hit
ATACTTAAAAGATTTTATATATATTTGTTATCAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAAATTTT11.0416666666666665No Hit
AAATACCTTCTATAACACCAAATAAAAAAAAACATAAACAAAAACCAAAACACAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTACGGGGATTCTAGGCTCCCCTGAGACAGCCGCGGCATCAACCAGCC11.0416666666666665No Hit
AACTAACAAAAAACAAGCAAAATAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GGGGGCTGGGGGGGGTGGGGGGGGGTGGGGGGGGCGGGGAGGGGGGGGGGGTGCGGGTGGG11.0416666666666665No Hit
CAAAAGTACACCATCAGGAAATAATCATAACCACTGTCAATAATTAAAAACTTAAGATCAC11.0416666666666665No Hit
GAGTACGTTATAATAAGAAAAACCAAATGAGAAATTAAAAAAAAAACAAAAGAAAAAATAA11.0416666666666665No Hit
TCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTAAACTTCTGGGCTGAAGCAATCCACCCACCACCTTG11.0416666666666665No Hit
GAGACGAGAAGAGGCCACCAAGGAAACCCCAAAACAAGCCCCCAATATGGAGAAATCGCCA11.0416666666666665No Hit
CTCCTAGAGCTACCTGTGGAGAAACCTGCTCAGATACATCAAACATGGAGACAGCACTCAA11.0416666666666665No Hit
GGCCAGAAGGACCAGGTCCACACATCAGATGTTTGCCCAGAGCTGGAGCCTCAGCTTGAAG11.0416666666666665No Hit
AAGCAAACTCCACAGATTATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAGAAAGAAAAAA11.0416666666666665No Hit
TTAATATCAACTAAAAGAAAAAAAAATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
CACTTCCCCTGCTCACTCACTAACAAATCTAAAAAGGCCTTCCACAAACACATACACCAAC11.0416666666666665No Hit
GTATAAACGAAAAGTACGGTAGATCTGATAGGGCTGAGCTTCCAAGACGATCAACATGCCT11.0416666666666665No Hit
ATATGCCACAGAATAGGGCCCAGTATAGGGGCAAGCTTTACTACTCCCTCCCCCCAATATA11.0416666666666665No Hit
CTCCAGCAGAAGCTCAATGAAAACGAAATCTCCGTGAAGATTCGGTGTACACGCGGCTAGA11.0416666666666665No Hit
AAGAAAAATCCTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GTCCTTACCCTTCAATTTAAGGAAGGAGAGTTATTGCCTAGCAGAATCTTGAAATAAAATT11.0416666666666665No Hit
CAGTAGTATTCCATACTCATCACCATCCATGGATGGCTGTTATGGCAGGAATGCATAGAGG11.0416666666666665No Hit
CTGCTGGTCAGTGGTGGCACTCCCCTCCCCAGCAAACCCGCCCAGCCACATGTGACTGCCT11.0416666666666665No Hit
GTGAATGATGGGCACATACTGCAGCCATAAGTTGAATGGAATGATGGGCACATCCTGCAGC11.0416666666666665No Hit
TCACAAAGCTATCCTATAAAACAAATATAAATTAATCTACTCAACCAAACTCTTATACAAA11.0416666666666665No Hit
CCATCACCCCACACAACCCAGCCTCCTACCCAACTCACCCCAACACAAACACCAATACCAA11.0416666666666665No Hit
CTAAACGTGGGTGTAAGCCCATCTTTCGTGCTTTCTCTCGCATTAAACCTAATGATTTTTC11.0416666666666665No Hit
AACAAGGGCTAAATTCGAACTACTCACTGCGGCAATCATTCCAGCAATCCTAATATTAAAA11.0416666666666665No Hit
TCATGTTGTATACTAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
ATGAAGCAAATGAACGTCGTGTCATGTCACGAATCGATGCTGCGTTAAGGATCAACTATCA11.0416666666666665No Hit
ATACGATTAACATTAAAACAAACAAACCAAAAAAACATATAATAAAAAAACAAATAAAAAC11.0416666666666665No Hit
ACAGCTTATGGTCTTCGTTCACCGAGTTTATAAAAACTTCGATCCACGTTCAAAAGTAATT11.0416666666666665No Hit
CGCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGGGGGGGGGTTTTGTTGGGGGGGGGGGGGG11.0416666666666665No Hit
GAATAATTTTCAACATCTAATCAGGCACTGCTTTAAACTGTAACCCCAGAATATTTTGTGT11.0416666666666665No Hit
GGCGCAATCAGGGTTGGAATTACAGGTGGATTTCTAGGAAATCGCTTCGGTAAACGAGCAG11.0416666666666665No Hit
ACACGAAAAAAGTTACAAGCTTTACCATTTCAAAATCAAATCAAGGTATAAATTTCGCTGA11.0416666666666665No Hit
TCTCAACCACCGTCATCTTTTAGAAACCTTTTATCTTTTCATTCCTCATGCTACTCTTCTA11.0416666666666665No Hit
TATTTAAAACTCTCCTCCCCAAACTAACTCACCAAAATATATTATATGATATTTACTGGAA11.0416666666666665No Hit
GAATAAATTCATTTGGTGTATGAATTTGTTGTATTTTTATATGAATGACGTAATATAATTA11.0416666666666665No Hit
CCGACAAACAACGCCGGAAAATAAATAAAACAAACCCACTTTATTCTAAACAAAGAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GCGTAGCGGGGAGCAGTGATTATTGATATTAATTTTCATAATCTTTTTTGTGCTTAAAATC11.0416666666666665No Hit
AGTACAAAAGACACAAATAATTAAACAAAAACCATAAAAACAAAATAAGCAAAACAACAAA11.0416666666666665No Hit
GTGGTGTGTTAGGGGAGTGGTTGTGTGTTTGGTTGGTTGTTATGTTTGTCTTATAAAAATA11.0416666666666665No Hit
CTTATATACTAAGATTTTGTCTGTTAAAAAAATATTGAAGAACATACTAACTTTCTGCTTT11.0416666666666665No Hit
AAAGCATCTCAGACGCTCAGGAAATAGAAACCTTATGAACTATCCTGCCCACCATCATCCT11.0416666666666665No Hit
TTATCACTTTGTTCAGGCACTGATGGCTGTGGACTTTTTGGGAGTGTTGTGTTAGTATTCA11.0416666666666665No Hit
GTCCATAGAGCAATCATCAATGATTTGATTTTTTAATTGATAACCAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
CACACAAAAACAACAATCAAGTGTTATGTATGATAAAAACATAGCATTTAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GAAAGTACTAAATCTTGTCAACATGGATATTAGAATAAATTTGGAATAAATTAATATATAA11.0416666666666665No Hit
CATAATGAGATATCATAATAGCCTCACCAAAATGGCTACAATGTAAAAGTCTGATCCACAC11.0416666666666665No Hit
GAAAATCTCACTTAGGAAGACGAAGTCGATGGAGCAATCAGCAAGGATTTGATGTTGGAAT11.0416666666666665No Hit
TATATATTATATGCCTTCTAGATCTTTTCATACTAAACATATTTATTTTAGAATGAAAAAA11.0416666666666665No Hit
CTTACAGAGGGCAGGACTTTGTTTGCCAGAGGCAGTCCATTTGGGCCAGTCAAACTTACAA11.0416666666666665No Hit
GAATCAACGAAAAGTAATGAAAATATTTATAAATTTATATTATAAATAACAGACTCACGCG11.0416666666666665No Hit
ATTACAATGTTTATGGCCATTCCAATTAAAAGCTGGCTATCAGGTCCATGGTAAGAAACCA11.0416666666666665No Hit
AAAAAAAAAACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAACGGAAAATCTCAATAAGGAAGA11.0416666666666665No Hit
ATCAAAACACAGAAAACGGTAAAAAAAAAAATACAAAAAAACACAACAACAACACGACGAT11.0416666666666665No Hit
GAGGCAAGAGCATCGAATGAGCCCATAACTTCAAGGATACAGTAAGCTATGATTACACCAA11.0416666666666665No Hit
TAACAGAAACGGAGTACAGATGTGAAAAAAATAGTTTTCTAATAATGATTGTATTAGTAAA11.0416666666666665No Hit
ATATTTTGGAAGCAGAAAAACTACACCATCCAATAATCCCAGCAGTGAGAATGATTCCTAC11.0416666666666665No Hit
GCTTAAGAAAATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAACAACCATGAA11.0416666666666665No Hit
ACCTTTAAAAAAGCTGTGGCCACAATCTAGGCTCAGAGCTACAAACAAGATCTCCAAAAAA11.0416666666666665No Hit
GACAGATATATACAAGGACAAAGAATCTACCGTGCAAGTTCATTATCGAATGTGCCAGAGC11.0416666666666665No Hit
GGGGGAACCAGGGAATAATTCCACCCATTTTATTCCCTCTCAAATATATATACATAAATCA11.0416666666666665No Hit
GATAAAATAAAACCCTAAATTGTTAGAAATATCGCATTTGCAATTTCCTGTGTCTGTATAG11.0416666666666665No Hit
ACACAAAACAAAAAATAACAAAAAGCAGAGAAAAGAATACAAAAACAAAAAAAACAAAAAA11.0416666666666665No Hit
AACTAAAAAAACACAAAGTATTAGAAATTCTTAATAACTATGTCATCAACAGATTGAAACA11.0416666666666665No Hit
TTAGTATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGGGTTTGTTGAGTTGTTGGT11.0416666666666665No Hit
GATGTTTCACTTCCCCTCGTTCGCCTCCCATGACTATGTATTCAACATGCGATAACTACCA11.0416666666666665No Hit
ATATTTTTCTACTAAAATAATACAAACAAAATCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11.0416666666666665No Hit
TTATCAACCCAGCGTCCCATAAAACTAAACGCTTTTATTAAACACCCACAAACCAATTCCA11.0416666666666665No Hit
GTTATCAACGCACAGTCGACGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTATTTTAAATAAATAA11.0416666666666665No Hit
GTGTTGAAGTGGGTGGTGGGGGTTTGTTTGTTGGGTTGATGTGGGTTTTGTGAAGATGGGG11.0416666666666665No Hit
ACATACACACTCATAACAAGAATCATTTTCCCTATATCGGATTGAATATCCCATAAAATTC11.0416666666666665No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
TAAATCA50.055.055
TATACAT50.055.049
TATATAT50.055.045
TATATAC50.055.047
AATTCCA50.055.017
AAATATA50.055.042
TTATTCC50.055.030
CTCTCAA50.055.037
CATTTTA50.055.026
CCCATTT50.055.024
TTTTATT50.055.028
ATAATTC50.055.015
TACATAA50.055.051
TTCCCTC50.055.033
AGGGAAT50.055.010
TCAAATA50.055.040
AACCAGG50.055.06
CCACCCA50.055.021
CCTCTCA50.055.036
ATAAATC50.055.054