FastQCFastQC Report
Wed 27 Apr 2022
EGAF00005416008

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005416008
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences12055188
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length125
%GC31

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT552290.45813470515764665No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC451670.3746685659319457No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT440190.3651456949489299No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA424330.3519895334689098No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT327180.2714018230159496No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA318150.26391127205979703No Hit
TGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA302120.250614092455464No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT289880.24046078750493147No Hit
TGGAGTAGTAAGTTATAATATGGGAGATTATTTTGAAGTTTGGTAGGATA270890.2247082335007965No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT238780.19807239837321494No Hit
TGGGTTTTGTTATTTTAATAAATTTTGTTTTTGGGTGGGTGTGGGTATAA233370.19358470394654984No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA213630.17721001115868124No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGAGTGTAATGGAA188690.15652182280359295No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA183710.1523908212796018No Hit
TGGGTGTGGTGGTTTATGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTTGAGGT183430.15215855613367457No Hit
TGGATGTTAGAGGGGTGTTTTGGGTAATTTTTGGGATTTAGAAGTGAAAG182210.15114654371213457No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGAGTGTAA165050.1369120083403096No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGATTGTAATGGAA161790.13420777842701415No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTCGAT156420.12975326473548152No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGAG143900.1193676946390218No Hit
CGGTTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTATCGTGTTAGTT131330.10894064862364651No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA130940.10861713645610503No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAATTTGAT123080.10209712200257681No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAA120620.10005650679193057No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)