FastQCFastQC Report
Wed 27 Apr 2022
EGAF00005416376

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005416376
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences16999694
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length125
%GC33

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT1022060.6012225867124432No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA725670.42687238958536544No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA722360.42492529571414633No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT611210.3595417658694327No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTCGAT420510.24736327606838102No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA338860.19933299975870156No Hit
CGGAACGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGATTGTAATGGAA337180.19834474667602842No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAA289160.17009717939628796No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAATGGAA265170.1559851606740686No Hit
CGGAATAGAATGGAATGTAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA242920.142896689787475No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC242070.142396680787313No Hit
CGGGTGGAGTGGAATGGAATGTAATGGAGTGGAATGTAATGGAATTTAGT234040.13767306635048843No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAG232270.13663187113838637No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGAT209840.12343751599293493No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT193870.11404322924871471No Hit
CGGGAGGCGGAGTTTGTAGTGAGTCGAGATCGCGTTATTGTATTTTAGTT192670.11333733418966248No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA192410.11318439026020116No Hit
CGGAATTGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGATTGTAATGGAATGGAA187590.11034904510634133No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAATTCGAT172760.10162535866822073No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)