FastQCFastQC Report
Wed 11 May 2022
EGAF00005416411

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005416411
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences25357228
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length125
%GC32

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT1512850.5966148981268773No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA1147110.4523798894737232No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA1050600.41431973557993007No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT913490.36024836784210007No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTCGAT570750.22508375126808028No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA551640.21754743854493874No Hit
CGGAACGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGATTGTAATGGAA508670.200601579951878No Hit
CGGGTGGAGTGGAATGGAATGTAATGGAGTGGAATGTAATGGAATTTAGT433690.17103210177390052No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAA421910.1663864835698918No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC419120.1652862055742055No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAATGGAA399370.15749749933234028No Hit
TGGAGTAGTAAGTTATAATATGGGAGATTATTTTGAAGTTTGGTAGGATA353180.13928178584820078No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGAT326880.12890998968814732No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT310550.12247001131196203No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAG307180.12114100168993236No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA297210.11720918390606418No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT292370.11530045792071594No Hit
CGGAATAGAATGGAATGTAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA281880.11116357040288473No Hit
CGGAACGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGATTGTAATGGAA281810.11113596486177432No Hit
CGGGAGGCGGAGTTTGTAGTGAGTCGAGATCGCGTTATTGTATTTTAGTT263590.103950636875608No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)