EGAF00005416684 FastQC Report

Basic Statistics

Measure	Value
Filename	EGAF00005416684
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	19769015
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	125
%GC	31

Per base quality graph

Per base quality graph

Per Sequence quality graph

Per sequence GC content graph

N content graph

Sequence length distribution

Duplication level graph

Sequence	Count	Percentage	Possible Source
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	104824	0.5302439195883053	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	70150	0.35484823093108075	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	52889	0.2675348265960646	No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC	48580	0.24573809064336286	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	47189	0.23870182707636167	No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA	40482	0.20477499764151122	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	33767	0.17080770083891383	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTCGAT	28285	0.14307743709031534	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA	26368	0.13338044409395208	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT	24408	0.12346593899594896	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGAT	23665	0.11970753221645085	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	22113	0.11185686287354225	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT	21574	0.10913037397159141	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAATGGAA	21545	0.1089836797635087	No Hit
TGGAGTAGTAAGTTATAATATGGGAGATTATTTTGAAGTTTGGTAGGATA	21211	0.10729416716007349	No Hit
CGGAACGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGATTGTAATGGAA	21068	0.1065708129615967	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAA	20719	0.10480542404363596	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA	20117	0.10176025462067786	No Hit

Adapter graph

Kmer graph

Sequence	Count	Obs/Exp Max	Max Obs/Exp Position
CGGCTAA	780	115.99695	1
CGGGTGC	9310	112.975555	1
CGGGCGC	24670	111.97989	1
CGGTTAA	76175	110.93055	1
CGGGTAC	9320	106.65917	1
CGGATGC	990	102.214226	1
GGGCGCG	30110	98.49496	2
CGGGTGT	29155	96.06035	1
GGGAGGC	50595	95.94084	2
CGGGAGG	111115	95.66603	1
CGGATTG	19135	95.59424	1
CGGGTAT	30810	93.91426	1
CGGGCAT	280	93.5389	1
CGGAATA	34330	92.81561	1
CGGGGAC	1940	92.355415	1
CGGGCGT	39665	90.791565	1
CGGGCTT	315	90.704384	1
CGGGTTT	58060	90.48666	1
CGGGTAA	9655	90.196495	1
CGGTAAT	11705	90.0118	1