FastQCFastQC Report
Thu 12 May 2022
EGAF00005416945

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005416945
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences36642009
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length125
%GC32

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT2342710.6393508609203169No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA1589680.4338408409866391No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT1175620.320839395023346No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT1017280.277626698907257No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA895160.2442988319772532No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC835500.22801697363264117No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA707950.19320720105712544No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT706010.19267775410458526No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA670100.1828775272665863No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT587380.16030234586755326No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTCGAT585910.15990116699114398No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA535770.1462174194651827No Hit
CGGTGGATTTTTCGGTTTAAGTTTTGGTAATACGGTGAAATTTCGTTTTA507980.13863322832544472No Hit
TGGGTGGAGTGGAATGGAATGTAATGGAGTGGAATGTAATGGAATTTAGT491220.13405924331277796No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGAT476070.12992464468855952No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT471090.12856554890317287No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGAGTGTAA471060.1285573615791645No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA466050.12719007846976949No Hit
CGGGAGGCGGAGTTTGTAGTGAGTCGAGATCGCGTTATTGTATTTTAGTT459720.12546255310400695No Hit
TGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA458420.12510776906364496No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAA441300.12043553616287797No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGAGTGTAATGGAA428560.11695865256733057No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTCGAGTGTAATGGAA428340.11689861219126932No Hit
CGGAACGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTGATTGTAATGGAA413000.11271216051499797No Hit
CGGGAGGCGGAGTTTGTAGTGAGTCGAGATTTCGTTATTGTATTTTAGTT383910.10477318533489799No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)