EGAF00005418222 FastQC Report

Basic Statistics

Measure	Value
Filename	EGAF00005418222
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	20047775
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	125
%GC	32

Per base quality graph

Per base quality graph

Per Sequence quality graph

Per sequence GC content graph

N content graph

Sequence length distribution

Duplication level graph

Sequence	Count	Percentage	Possible Source
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC	54867	0.27368124392856563	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	48059	0.23972236320489432	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	34188	0.17053264015582775	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	32576	0.16249184759904778	No Hit
TGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	31524	0.15724438248134767	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT	29075	0.1450285630200858	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	25175	0.12557503264077932	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	25052	0.12496149822112429	No Hit
TGGGTGGAGTGGAATGGAATGTAATGGAGTGGAATGTAATGGAATTTAGT	20953	0.10451533898400198	No Hit

Adapter graph

Kmer graph

Sequence	Count	Obs/Exp Max	Max Obs/Exp Position
CGGGTGC	11960	111.48882	1
CGGTTAA	77860	109.39801	1
CGGGCGC	31715	106.44112	1
CGGGTAC	12160	105.200386	1
CGGCTAA	605	103.31145	1
CGGGTGT	36765	95.02635	1
CGGGTAT	41340	94.34479	1
GGGCGCG	39290	94.24903	2
GGGAGGC	56565	93.92618	2
CGGGAGG	129420	92.229706	1
CGGAATA	17925	91.357864	1
CGGTAAT	12255	90.29851	1
CGGGTTT	76725	90.14599	1
CGGATGC	1105	89.96399	1
CGGGTAA	10660	89.123085	1
CGCGGTG	39230	88.943146	5
CGGATAC	1225	87.95429	1
GCGCGGT	39720	87.93579	4
GGCGCGG	40805	87.66827	3
CGGGCGT	54335	86.3956	1