EGAF00005418482 FastQC Report

Basic Statistics

Measure	Value
Filename	EGAF00005418482
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	20164417
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	125
%GC	32

Per base quality graph

Per base quality graph

Per Sequence quality graph

Per sequence GC content graph

N content graph

Sequence length distribution

Duplication level graph

Sequence	Count	Percentage	Possible Source
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	56502	0.280206464684796	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	56397	0.27968574543960284	No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC	50572	0.25079822540864927	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	38756	0.19219995301624637	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	36145	0.17925140111910998	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT	32099	0.15918635287100044	No Hit
TGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	30788	0.1526848011524459	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	27515	0.13645323839513931	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	26900	0.1334033113875794	No Hit
TGGGTGGAGTGGAATGGAATGTAATGGAGTGGAATGTAATGGAATTTAGT	24992	0.12394109881778383	No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA	24919	0.1235790749616019	No Hit
CGGTTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTATCGTGTTAGTT	22922	0.11367549084111879	No Hit

Adapter graph

Kmer graph

Sequence	Count	Obs/Exp Max	Max Obs/Exp Position
CGGTTAA	97295	112.04399	1
CGGGTGC	10510	111.90067	1
CGGGTAC	11265	105.98592	1
CGGGCGC	28570	105.72417	1
CGGCTAA	1280	105.55148	1
CGGGAGG	123630	96.75589	1
GGGAGGC	55460	96.609795	2
CGGGTGT	31140	96.00482	1
GGGCGCG	34120	94.52698	2
CGGAATA	24930	93.87279	1
CGGTAAT	12725	93.03052	1
CGGGTAT	34380	92.98175	1
CGGGTTT	66790	89.96764	1
CGGGTAA	10190	89.07259	1
CGGGCGT	42450	89.01765	1
CGGGAAG	18325	88.63556	1
CGGAAAT	10175	88.32649	1
CGGATGC	1295	88.24293	1
GCGGAGT	35450	87.962105	7
CGCGGTG	35695	86.89165	5