EGAF00005418667 FastQC Report

Basic Statistics

Measure	Value
Filename	EGAF00005418667
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	17862312
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	125
%GC	31

Per base quality graph

Per base quality graph

Per Sequence quality graph

Per sequence GC content graph

N content graph

Sequence length distribution

Duplication level graph

Sequence	Count	Percentage	Possible Source
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	64796	0.3627525932813177	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	52336	0.29299678563446885	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	41531	0.2325062959375024	No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA	33938	0.18999780095656152	No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC	27721	0.1551926760656739	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	27538	0.15416817263073224	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT	23449	0.13127639915818287	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAATTTTATTGTAATGGAATGGAA	21912	0.12267168998055795	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	20873	0.1168549737570366	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT	19404	0.10863095438037361	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTCGAT	18596	0.10410746380423766	No Hit

Adapter graph

Kmer graph

Sequence	Count	Obs/Exp Max	Max Obs/Exp Position
CGGCTAA	770	108.227455	1
CGGTTAA	64435	108.12164	1
CGGGTGC	6875	107.5348	1
CGGGCGC	17075	99.841805	1
GGGAGGC	47170	97.75166	2
CGGGTAC	6710	97.316	1
CGGGAGG	100105	97.013336	1
CGGATGC	630	94.48429	1
CGGAATA	27485	94.40418	1
CGGTAAT	10180	92.21127	1
CGGGTGT	22840	90.87742	1
CGGGAAG	14265	89.924	1
CGGGTAA	7820	89.43989	1
GCGGAGT	30685	89.40739	7
CGGGTTT	50610	88.91716	1
CGGATGA	5435	88.274574	1
GGGCGCG	22495	87.99067	2
CGGAGTA	9380	86.622345	1
CGGGTAT	23680	86.29631	1
CGGAATG	138295	84.73272	1