EGAF00005419011 FastQC Report

Basic Statistics

Measure	Value
Filename	EGAF00005419011
File type	Conventional base calls
Encoding	Sanger / Illumina 1.9
Total Sequences	19424638
Sequences flagged as poor quality	0
Sequence length	125
%GC	30

Per base quality graph

Per base quality graph

Per Sequence quality graph

Per sequence GC content graph

N content graph

Sequence length distribution

Duplication level graph

Sequence	Count	Percentage	Possible Source
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	46952	0.2417136422310676	No Hit
TGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	44793	0.2305988919844993	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	38788	0.19968454495780052	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGTAAAGTAATGGAATTAATTTGAT	33095	0.17037640547020746	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGAAATGTAATGGATTTAAT	30948	0.1593234324366817	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAA	28850	0.14852271635641293	No Hit
CGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATGGAACGGAATGGAATGGAATGGAA	27547	0.14181474064021166	No Hit
TGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	26525	0.13655338132942296	No Hit
CGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAATTAAT	21208	0.10918092785049585	No Hit
CGGGCGCGGTGGTTTACGTTTGTAATTTTAGTATTTTGGGAGGTCGAGGC	19701	0.10142273951257161	No Hit

Adapter graph

Kmer graph

Sequence	Count	Obs/Exp Max	Max Obs/Exp Position
CGGGTGC	6470	107.44782	1
CGGCTAA	680	106.784935	1
CGGTTAA	52025	105.64206	1
GGGAGGC	53345	99.27813	2
CGGGAGG	114035	98.0726	1
CGGAATA	23940	96.04165	1
CGGGTAC	6050	95.32953	1
CGGGCGC	13910	93.87902	1
GCGGAGT	33850	92.051025	7
CGGGTGT	23960	89.32888	1
CGGGTTT	50175	89.25251	1
CGGTAAT	10240	88.93046	1
CGGGAAG	15630	87.77504	1
CGGGTAA	8430	87.19638	1
GGAGGCG	61140	86.14448	3
GGCGGAG	60640	85.549126	6
CGGGTAT	23765	85.15304	1
CGGGATA	7090	83.612686	1
CGGATGC	635	83.421	1
CGGTATT	23310	82.88297	1