FastQCFastQC Report
Sat 23 Apr 2022
EGAF00005490986

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005490986
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences79589
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGACTACAAGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG5920.7438213823518326No Hit
GGACTACACGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG5730.7199487366344596No Hit
GGACTACACGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG5720.7186922815967031No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG5720.7186922815967031No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT5000.6282275188782369No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT4840.6081242382741334No Hit
GGACTACAGGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG4490.5641483119526568No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT4490.5641483119526568No Hit
GGACTACCAGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG4330.5440450313485532No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG4280.5377627561597708No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG4200.527711115857719No Hit
GGACTACTAGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG4160.5226852957066932No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT4050.5088642902913719No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG4010.503838470140346No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG3990.5013255600648331No Hit
GGACTACTCGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG3740.46991418412092123No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG3730.4686577290831648No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3620.45483672366784356No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3620.45483672366784356No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3560.4472979934413047No Hit
GGACTACCCGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG3430.43096407795047054No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3280.41211725238412344No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG3250.40834788727085397No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3240.4070914322330975No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3220.4045785221575846No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3190.4008091570443152No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG3160.3970397919310457No Hit
GGACTACCGGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG3050.3832187865157245No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC3010.3781929663646987No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT3000.37693651132694217No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT2920.36688487102489037No Hit
GGACTACTGGGGTATCTATGACTCTTGTCAACGTATAAGCCTTCCTGTTG2910.3656284159871339No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT2910.3656284159871339No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC2870.360602595836108No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA2720.3417557702697609No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT2650.3329605850054656No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC2570.3229089447034138No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT2510.31537021447687497No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA2500.31411375943911846No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA2480.3116008493636055No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC2430.3053185741748231No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT2410.3028056640993102No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGAAATAATCTCATT2390.3002927540237973No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC2310.29024111372174544No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC2280.286471748608476No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC2250.28270238349520665No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC2220.2789330183819372No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA2200.2764201083064243No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC2160.27139428815539834No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC2160.27139428815539834No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC2150.2701378331176419No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA2100.2638555579288595No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC2100.2638555579288595No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC2020.2538039176268077No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1980.24877809747578186No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1960.2462651874002689No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1950.24500873236251242No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1950.24500873236251242No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1940.24375227732475593No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1920.241239367249243No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1920.241239367249243No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1890.23747000213597355No Hit
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GGACTACTAGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1860.23370063702270413No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1850.23244418198494765No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1840.23118772694719117No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1840.23118772694719117No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1830.22993127190943474No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1820.22867481687167826No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1770.22239254168289588No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1770.22239254168289588No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1690.21234090138084408No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1690.21234090138084408No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1690.21234090138084408No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1680.21108444634308762No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1670.20982799130533114No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1640.20605862619206172No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1600.20103280604103582No Hit
GGACTACTCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1580.19851989596552286No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1570.19726344092776638No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1570.19726344092776638No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1570.19726344092776638No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1570.19726344092776638No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1560.19600698589000992No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1550.19475053085225347No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1510.18972471070122754No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1500.18846825566347108No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1480.18595534558795815No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1470.18469889055020167No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC1450.1821859804746887No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1450.1821859804746887No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1430.17967307039917577No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1420.1784166153614193No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1410.17716016032366283No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1410.17716016032366283No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA1390.17464725024814987No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1390.17464725024814987No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1380.17339079521039338No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1360.17087788513488045No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1360.17087788513488045No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1320.16585206498385455No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC1310.16459560994609806No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1280.16082624483282867No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1280.16082624483282867No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1200.15077460453077687No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC1190.1495181494930204No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1180.1482616944552639No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC1140.143235874304238No Hit
GGACTACCCGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1100.13821005415321214No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGCTATTGTGTGTTC1090.13695359911545565No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGCGCTTCA1040.1306713239266733No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC1030.12941486888891682No Hit
GGACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC1030.12941486888891682No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC980.12313259370013445No Hit
GGACTACCAGGGTATCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC980.12313259370013445No Hit
GGACTACACGGGTTTCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGCGCTTCA970.12187613866237797No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGCGCTTCA960.1206196836246215No Hit
GGACTACAGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC950.11936322858686502No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC940.11810677354910853No Hit
GGACTACAAGGGTATCTACATTGGTAAGACATAAGCCTGGGGTTCCTGGC940.11810677354910853No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAACACCGGATGTGCTCTGACTCGCCCACTTCCG910.11433740843583913No Hit
GGACTACAGGGGTATCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC910.11433740843583913No Hit
GGACTACACGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCATGCTTTCGCGCTTCA900.11308095339808266No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC900.11308095339808266No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC890.11182449836032618No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATGGCTGACAGATTATCCTGTGTGCTTGGAGG850.10679867820930027No Hit
GGACTACCGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC800.10051640302051791No Hit
GGACTACTGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC800.10051640302051791No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
GGACTAC75100.0295.01
GACCCGG108.4502506E-4295.05
GGAAGAC157.215109E-6295.01
CTACCGG6250.0292.644
GACTACC23150.0292.45142
ACGGGTA4500.0291.722238
TACTCGG8700.0291.60925
CTACCCG7700.0291.168824
CGGGGTA2800.0289.732158
AAGGGTA5100.0289.21578
CAAGGGT11650.0288.66957
TCGGGTT4450.0288.37088
GGGGTAT8700.0288.218389
TACTAGG8650.0288.17925
CGGGTAT12800.0288.085949
ACTACCG6350.0288.03153
TACACGG10050.0287.661685
GGGGTTT11850.0287.531659
ACTACCC7800.0287.435883
CTACTCG8800.0286.619324
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