FastQCFastQC Report
Sat 23 Apr 2022
EGAF00005491222

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005491222
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
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Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

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[OK]Per tile sequence quality

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[OK]Per sequence quality scores

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[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGACTACAAGGGTATCTACATTGGTAAGACATAAGCCTGGGGTTCCTGGC510.10519584992058745No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAAAAGGCTAGATAGTAACTGTGGAATTTTGCAA500.10313318619665436No Hit
GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC500.10313318619665436No Hit
GGACTACTCGGGTTTCTAATGGCTGACAGATTATCCTGTGTGCTTGGAGG500.10313318619665436No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAAAAGGCTAGATAGTAACTGTGGAATTTTGCAA500.10313318619665436No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[FAIL]Kmer Content

Kmer graph

SequenceCountPValueObs/Exp MaxMax Obs/Exp Position
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