FastQCFastQC Report
Wed 8 May 2024
EGAF00005491360

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005491360
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences73164
Total Bases22 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGACTACTAGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC810.110710185337051No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATGGTCCCTGGAGTTTCTCGGCACAGAGCTCA790.10797660051391396No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATTTTCCTCTCACCTCCCTACTGCTCCTTCTC780.10660980810234541No Hit
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GGACTACTAGGGTATCTAATCTTGGCTGCACACTAGCATCACTCTGGTTT760.10387622327920835No Hit
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GGACTACAGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC740.10114263845607128No Hit
GGACTACTAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCATGA740.10114263845607128No Hit
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[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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