FastQCFastQC Report
Wed 8 May 2024
EGAF00005491574

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005491574
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences80614
Total Bases24.2 Mbp
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length301
%GC45

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGACTACCGGGGTATCTAATCCCAGTTTGAATCTTCGCTATTGTGTATTC1440.17862902225419902No Hit
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GGACTACTCGGGTATCTACATTGGTAAGACATAAGCCTGGGGTTCCTGGC1050.1302503287270201No Hit
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GGACTACCGGGGTTTCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC860.10668122162403554No Hit
GGACTACTGGGGTATCTAATCCCAGTTTGGGTCTTAGTTATTCTGTGTTC850.10544074230282581No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATGGTCCCTGGAGTTTCTCGGCACAGAGCTCA840.1042002629816161No Hit
GGACTACACGGGTATCTAACACCGGATGTGCTCTGACTCGCCCACTTCCG840.1042002629816161No Hit
GGACTACCAGGGTTTCTAATAGCTGAAGCTTAGCATGTCTCCTGATCTTA830.10295978366040637No Hit
GGACTACAAGGGTTTCTAATAAGGGTTTGGGGACCTGACATAATCTCATT830.10295978366040637No Hit
GGACTACAAGGGTATCTAATGGCTGACAGATTATCCTGTGTGCTTGGAGG820.10171930433919667No Hit
GGACTACCGGGGTATCTACATTGGTAAGACATAAGCCTGGGGTTCCTGGC810.10047882501798697No Hit
GGACTACCCGGGTTTCTAATCCCAGTTTGTGCCTTAGCTGTTGTGTCCTC810.10047882501798697No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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