FastQCFastQC Report
Wed 8 May 2024
EGAF00005492178

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00005492178
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
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Total Bases18.9 Mbp
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Sequence length301
%GC46

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

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[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

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Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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