FastQCFastQC Report
Wed 14 Sep 2022
EGAF00006623088

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623088
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15921
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length500-5260
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC8115.093901136863263No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC5053.171911312103511No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC4432.7824885371521892No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC4262.675711324665536No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC3192.0036429872495445No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC3041.9094277997613214No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA2561.6079391997990073No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC2231.4006657873249169No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC2201.3818227498272722No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC2131.337855662332768No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG2101.3190126248351233No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1991.2499214873437599No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1861.1682683248539665No Hit
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AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1751.0991771873626028No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1701.0677721248665286No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC1580.99239997487595No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1490.9358708623830161No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1420.891903774888512No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1380.8667797248916526No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1120.7034733999120658No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC1110.697192387412851No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1100.6909113749136361No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1060.6657873249167766No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1000.6281012499214873No Hit
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AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG880.5527290999309088No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC870.546448087431694No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG850.5338860624332643No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG840.5276050499340493No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA810.5087620124364047No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG770.48363796243954527No Hit
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AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC730.4585139124426858No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT700.43967087494504115No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG670.4208278374473965No Hit
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AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG580.36429872495446264No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA560.3517366999560329No Hit
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AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA530.3328936624583883No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG530.3328936624583883No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG520.32661264995917344No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG520.32661264995917344No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG500.31405062496074365No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG500.31405062496074365No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC490.3077696124615288No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG490.3077696124615288No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG490.3077696124615288No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC490.3077696124615288No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG480.3014885999623139No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC480.3014885999623139No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG480.3014885999623139No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG470.29520758746309905No Hit
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AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG450.2826455624646693No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC450.2826455624646693No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG420.26380252496702467No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT400.25124049996859493No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGCG390.24495948746938007No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG390.24495948746938007No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG390.24495948746938007No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG370.23239746247095033No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG370.23239746247095033No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG360.22611644997173544No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT360.22611644997173544No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG360.22611644997173544No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG350.21983543747252057No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG340.21355442497330568No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG340.21355442497330568No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG330.2072734124740908No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG330.2072734124740908No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG320.20099239997487592No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTTTTACCCTAGGCAGC320.20099239997487592No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG310.19471138747566108No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG310.19471138747566108No Hit
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AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG300.1884303749764462No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG300.1884303749764462No Hit
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AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG280.17586834997801645No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACCAGACCTGCCTTCGGCAGC270.1695873374788016No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTGTCCCACCGTGACCGGC270.1695873374788016No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTAGTTTTACCCTAAACAGC230.1444632874819421No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG220.1381822749827272No Hit
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AGGGTTCGATTCTGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG210.13190126248351233No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT200.12562024998429747No Hit
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AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG190.11933923748508259No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC190.11933923748508259No Hit
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AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.11305822498586772No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG180.11305822498586772No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT180.11305822498586772No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG170.10677721248665284No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTTTTACCCTAGGCAGC170.10677721248665284No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGCT170.10677721248665284No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG170.10677721248665284No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG160.10049619998743796No Hit
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