FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623089

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623089
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences16692
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length511-4559
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC10646.374311047208243No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC6533.9120536784088187No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC6303.7742631200575123No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG5253.145219266714594No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG4432.653965971722981No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC3592.150730889048646No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA3081.8451953031392285No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC2581.5456506110711719No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG2541.5216870357057273No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2401.4378145219266714No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2191.3120057512580876No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC2141.282051282051282No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC2081.2461059190031152No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG2051.228133237479032No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1971.1802060867481428No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1921.1502516175413373No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1821.0903426791277258No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1771.06038820992092No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC1701.0184519530313922No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAGCCCTACCGTGGTAAGC1620.9705248023005032No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1440.8626887131560028No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1360.8147615624251139No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1310.7848070932183081No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC1240.7428708363287803No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1180.7069254732806135No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1140.6829618979151689No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAACCCTACCGTGGTAATC1140.6829618979151689No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC1120.6709801102324467No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1110.6649892163910855No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAGCCCTACCGTGGTAAGC1110.6649892163910855No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC1040.6230529595015576No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGCAAGC1030.6170620656601965No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG940.5631440210879463No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG930.5571531272465852No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAACCATACCGTGGTAAAC930.5571531272465852No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG920.5511622334052241No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG880.5271986580397795No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAACCCTACCGTGGTAATC880.5271986580397795No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG790.47328061346752937No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGCAAGC740.44332614426072375No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTTACACATG730.43733525041936255No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC690.41337167505391803No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG690.41337167505391803No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA670.4013898873711958No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG660.39539899352983465No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG620.37143541816439013No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG600.35945363048166784No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG600.35945363048166784No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG590.35346273664030675No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC580.3474718427989456No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAACCATACCGTGGTAAAC580.3474718427989456No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG570.34148094895758446No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG560.3354900551162234No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG540.3235082674335011No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTTACACATG540.3235082674335011No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG510.3055355859094177No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTCGCTCTAGGCCGA500.29954469206805656No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG500.29954469206805656No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA490.2935537982266954No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTCACCCTAGGCCGA480.28756290438533433No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG480.28756290438533433No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA470.28157201054397313No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTAGTTTTACCCTAAACAGC460.27558111670261204No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC450.2695902228612509No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA450.2695902228612509No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA440.26359932901988975No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG430.25760843517852866No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG430.25760843517852866No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG410.24562664749580637No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA400.23963575365444525No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG400.23963575365444525No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGCC400.23963575365444525No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC390.23364485981308408No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTAGTTTTACCCTAAACAGC390.23364485981308408No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG390.23364485981308408No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG380.227653965971723No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTCACCCTAGGCCGA380.227653965971723No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC370.22166307213036188No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT360.2156721782890007No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG350.2096812844476396No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG340.20369039060627847No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG330.19769949676491733No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA320.1917086029235562No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTTTTACCCTAGGCAGC320.1917086029235562No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG320.1917086029235562No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA320.1917086029235562No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG310.18571770908219506No Hit
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AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG310.18571770908219506No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG300.17972681524083392No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG290.1737359213994728No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTTACACATG280.1677450275581117No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC280.1677450275581117No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT280.1677450275581117No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC270.16175413371675054No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC260.1557632398753894No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTTAGC260.1557632398753894No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG260.1557632398753894No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG260.1557632398753894No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT260.1557632398753894No Hit
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AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG250.14977234603402828No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC250.14977234603402828No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC240.14378145219266716No Hit
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AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG230.13779055835130602No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG230.13779055835130602No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCC230.13779055835130602No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTTACACATG230.13779055835130602No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC220.13179966450994487No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACGAACCCTGCCGTGGTAATC220.13179966450994487No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA220.13179966450994487No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTGACCCCAATCACTAGTCCTACCTTCGACGGC220.13179966450994487No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACCTTCCCCACCTTAGACGGC220.13179966450994487No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG220.13179966450994487No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG210.12580877066858376No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG200.11981787682722263No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCGACGCCACCTTCGACGAC200.11981787682722263No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTCGCTCTAGGCCGA200.11981787682722263No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC200.11981787682722263No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTTAGC190.1138269829858615No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG190.1138269829858615No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGGCCACACCGTGGTAACC190.1138269829858615No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAACCCCAATCATGCCCCCCACCTTAGGCCGA190.1138269829858615No Hit
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GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGCG180.10783608914450035No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAGCCCTACCGTGGTAAGC180.10783608914450035No Hit
CAGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACAT180.10783608914450035No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC180.10783608914450035No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG180.10783608914450035No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG170.10184519530313924No Hit
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AGTTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC170.10184519530313924No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG170.10184519530313924No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGGTACC170.10184519530313924No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC170.10184519530313924No Hit

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