FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623092

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623092
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences8103
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length529-3134
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA3604.442798963346909No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC2803.4555103048253732No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA2212.727384919165741No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC1672.060965074663705No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1662.048623966432186No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG1521.875848451190917No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG1471.814142910033321No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1371.690731827718129No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG1211.493274096013822No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC1201.480932987782303No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG1091.3451807972355918No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG961.1847463902258424No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG931.1477230655312847No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA931.1477230655312847No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG921.1353819572997657No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG861.0613353079106502No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC750.9255831173639394No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG750.9255831173639394No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG730.9009009009009009No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG710.8762186844378625No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG670.8268542515117858No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA660.8145131432802665No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC660.8145131432802665No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC650.8021720350487473No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT590.7281253856596323No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA550.6787609527335554No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG550.6787609527335554No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC540.6664198445020363No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG540.6664198445020363No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG480.5923731951129212No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG470.580032086881402No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG470.580032086881402No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC470.580032086881402No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG440.5430087621868444No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG420.518326545723806No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA410.5059854374922867No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG410.5059854374922867No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC410.5059854374922867No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG400.4936443292607676No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGC390.4813032210292484No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA380.46896211279772926No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG380.46896211279772926No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC370.45662100456621No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC370.45662100456621No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT370.45662100456621No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG360.4442798963346909No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG360.4442798963346909No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA360.4442798963346909No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT350.43193878810317166No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGCCCCCACCTTCGACGGC350.43193878810317166No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG340.4195976798716525No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT330.40725657164013324No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC310.3825743551770949No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGCCCCCACCTTCGACGGC300.37023324694557574No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG290.35789213871405656No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG290.35789213871405656No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG270.33320992225101814No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA260.32086881401949896No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT260.32086881401949896No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG250.3085277057879798No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT250.3085277057879798No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG240.2961865975564606No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC240.2961865975564606No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG240.2961865975564606No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT240.2961865975564606No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC240.2961865975564606No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC230.2838454893249414No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC230.2838454893249414No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC230.2838454893249414No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG220.2715043810934222No Hit
GGGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCG220.2715043810934222No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG220.2715043810934222No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG220.2715043810934222No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG200.2468221646303838No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG200.2468221646303838No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACGCACACACGCGCGGGCTACCTTGTTACG190.23448105639886463No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG190.23448105639886463No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG190.23448105639886463No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGCCCCCACCTTCGACGGC190.23448105639886463No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGC190.23448105639886463No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT180.22213994816734545No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG180.22213994816734545No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.22213994816734545No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTCGCTCTAGGCCGA170.20979883993582624No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGAT160.19745773170430705No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG160.19745773170430705No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA160.19745773170430705No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC160.19745773170430705No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG160.19745773170430705No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA150.18511662347278787No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.18511662347278787No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC150.18511662347278787No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG150.18511662347278787No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACGCACACACGCGCGGGCTACCTTGTTACG140.17277551524126866No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC140.17277551524126866No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTGTCCCACCGTGACCGGC140.17277551524126866No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG140.17277551524126866No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACGCACACACGCGCGGGCTACCTTGTTACG140.17277551524126866No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT140.17277551524126866No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGC130.16043440700974948No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG130.16043440700974948No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG130.16043440700974948No Hit
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AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC120.1480932987782303No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG120.1480932987782303No Hit
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AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG120.1480932987782303No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT110.1357521905467111No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG110.1357521905467111No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG110.1357521905467111No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG110.1357521905467111No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT110.1357521905467111No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAACCCCAATCATGCCCCCCACCTTAGGCCGA110.1357521905467111No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC110.1357521905467111No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT110.1357521905467111No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT110.1357521905467111No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG110.1357521905467111No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG110.1357521905467111No Hit
AGGGTTTGATTCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACAT110.1357521905467111No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT110.1357521905467111No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG100.1234110823151919No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTTGCCCTAGGCCG100.1234110823151919No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTTGCCCTAGGCCG100.1234110823151919No Hit
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GAGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACAT100.1234110823151919No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG100.1234110823151919No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC90.11106997408367272No Hit
GAGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACAT90.11106997408367272No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG90.11106997408367272No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC90.11106997408367272No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATTGATTCTACCTTCGACTGC90.11106997408367272No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG90.11106997408367272No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG90.11106997408367272No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG90.11106997408367272No Hit
GAGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCG90.11106997408367272No Hit
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