FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623098

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623098
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences8828
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length505-5982
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC1952.20888083371092No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA1792.027639329406434No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1111.2573629361123697No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1101.2460353420933394No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC640.724966017217943No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC590.6683280471227911No Hit
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AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC450.5097417308563661No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGGTACC390.4417761667421839No Hit
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AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG310.3511554145899411No Hit
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AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG300.33982782057091077No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG300.33982782057091077No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGGTACC290.3285002265518804No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG290.3285002265518804No Hit
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AGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG280.31717263253285005No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG280.31717263253285005No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG280.31717263253285005No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG270.30584503851381967No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA250.28318985047575895No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA240.2718622564567286No Hit
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AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG240.2718622564567286No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG230.26053466243769824No Hit
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GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAACG230.26053466243769824No Hit
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AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG160.18124150430448574No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGGCCACACCGTGGTAAGC110.12460353420933393No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC110.12460353420933393No Hit
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GGTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGAT100.11327594019030357No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCGACGCCACCTTCGACGAC90.10194834617127321No Hit
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[OK]Adapter Content

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