FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623106

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623106
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences8126
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length526-3054
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC6838.405119369923701No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA6648.171301993600789No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC3944.8486340142751665No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC1561.9197637213881367No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA1531.882845188284519No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1461.7967019443760768No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTGTCCCACCGTGACCGGC991.2183115924193946No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG921.1321683485109524No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG901.1075559931085406No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG881.0829436377061286No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG800.9844942160964805No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC760.9352695052916564No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA730.8983509721880384No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA700.8614324390844204No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC670.8245139059808023No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG570.7014521289687423No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTGACCCCAATCACTAGTCCTACCTTCGACGGC560.6891459512675363No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG550.6768397735663303No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC520.6399212404627123No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG480.5906965296578882No Hit
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AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG440.5414718188530643No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG430.5291656411518583No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG420.5168594634506523No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG420.5168594634506523No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG410.5045532857494461No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC410.5045532857494461No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG400.49224710804824023No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG400.49224710804824023No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGGTACC400.49224710804824023No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTAGACGGC390.47994093034703417No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG370.4553285749446222No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA340.41841004184100417No Hit
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AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG340.41841004184100417No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG320.39379768643859214No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG310.38149150873738613No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC300.3691853310361802No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA300.3691853310361802No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG290.35687915333497416No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG290.35687915333497416No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG280.34457297563376815No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG280.34457297563376815No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT270.33226679793256214No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG270.33226679793256214No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG260.31996062023135613No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG250.3076544425301502No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG250.3076544425301502No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG250.3076544425301502No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG250.3076544425301502No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG240.2953482648289441No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG240.2953482648289441No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCGACGCCACCTTCGACGAC230.2830420871277381No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGAC230.2830420871277381No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG220.27073590942653214No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG220.27073590942653214No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG220.27073590942653214No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG220.27073590942653214No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG220.27073590942653214No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG220.27073590942653214No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG210.25842973172532613No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC210.25842973172532613No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG200.24612355402412012No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG200.24612355402412012No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA200.24612355402412012No Hit
TGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAG190.2338173763229141No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG190.2338173763229141No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC190.2338173763229141No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG190.2338173763229141No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG190.2338173763229141No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.22151119862170812No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG180.22151119862170812No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.22151119862170812No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG180.22151119862170812No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGCG170.20920502092050208No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC170.20920502092050208No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC170.20920502092050208No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTGACCCCAATCACTAGTCCTACCTTCGACGGC160.19689884321929607No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC160.19689884321929607No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG160.19689884321929607No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTCACCCTAGGCCGA150.1845926655180901No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG150.1845926655180901No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG150.1845926655180901No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG150.1845926655180901No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.1845926655180901No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG140.17228648781688408No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG140.17228648781688408No Hit
TGGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCG140.17228648781688408No Hit
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AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG120.14767413241447205No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT120.14767413241447205No Hit
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AGGGTTTGATTCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACAT120.14767413241447205No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG120.14767413241447205No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG110.13536795471326607No Hit
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AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG110.13536795471326607No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA110.13536795471326607No Hit
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AGAGTTTGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACAT100.12306177701206006No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA100.12306177701206006No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG100.12306177701206006No Hit
AGAGTTTGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACAT100.12306177701206006No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG100.12306177701206006No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG100.12306177701206006No Hit
AGGGTTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACAT100.12306177701206006No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG100.12306177701206006No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG100.12306177701206006No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCTAGCCCCACCTTTAACCGC90.11075559931085406No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGCT90.11075559931085406No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG90.11075559931085406No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAACCCCAATCATGCCCCCCACCTTAGGCCGA90.11075559931085406No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG90.11075559931085406No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC90.11075559931085406No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG90.11075559931085406No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG90.11075559931085406No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG90.11075559931085406No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG90.11075559931085406No Hit

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