FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623111

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623111
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences12129
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length501-3966
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA4773.932723225327727No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG4363.5946904114106686No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA4353.5864457086322035No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC4223.4792645725121614No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG3512.8938906752411575No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA3452.8444224585703686No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA2792.3002720751916894No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC2391.970483964053096No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG2161.7808558001484047No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG2011.657185258471432No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC1691.3933547695605575No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1661.3686206612251628No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG1591.310907741775909No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC1481.2202160112127958No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC1361.1212795778712177No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA1140.9398961167449914No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG1090.8986726028526671No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA1030.8492043861818781No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC1010.8327149806249484No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG980.807980872289554No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC930.7667573583972298No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC930.7667573583972298No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG930.7667573583972298No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG870.7172891417264408No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC760.6265974111633276No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG740.6101080056063979No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC730.6018633028279331No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA730.6018633028279331No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA720.5936186000494682No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG720.5936186000494682No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG710.5853738972710034No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC690.5688844917140736No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG670.552395086157144No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG660.5441503833786792No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC630.5194162750432847No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG600.4946821667078902No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG590.48643746392942533No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA570.4699480583724957No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG560.4617033555940308No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC550.453458652815566No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCGACGCCACCTTCGACGAC500.41223513892324176No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC490.403990436144777No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG490.403990436144777No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG490.403990436144777No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA490.403990436144777No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG490.403990436144777No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG480.39574573336631214No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC480.39574573336631214No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG480.39574573336631214No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG470.3875010305878473No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGGTACC470.3875010305878473No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG460.37925632780938245No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG440.3627669222524528No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA430.354522219473988No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG420.34627751669552315No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG410.33803281391705825No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT400.32978811113859346No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA400.32978811113859346No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAACCCCAATCATGCCCCCCACCTTAGGCCGA390.3215434083601286No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTCACCCTAGGCCGA390.3215434083601286No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTCACCCTAGGCCGA390.3215434083601286No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG380.3132987055816638No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC370.30505400280319894No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG370.30505400280319894No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGC360.2968093000247341No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG360.2968093000247341No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC330.2720751916893396No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG310.2555857861324099No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG310.2555857861324099No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC300.2473410833539451No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC300.2473410833539451No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG290.23909638057548027No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA280.2308516777970154No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG280.2308516777970154No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG280.2308516777970154No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG270.2226069750185506No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT270.2226069750185506No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT270.2226069750185506No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA260.21436227224008575No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG260.21436227224008575No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG250.20611756946162088No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC250.20611756946162088No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGGTACC240.19787286668315607No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG240.19787286668315607No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA240.19787286668315607No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG240.19787286668315607No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG230.18962816390469123No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG230.18962816390469123No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG230.18962816390469123No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAACCCCAATCATGCCCCCCACCTTAGGCCGA230.18962816390469123No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG230.18962816390469123No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT230.18962816390469123No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG230.18962816390469123No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG230.18962816390469123No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC220.1813834611262264No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG220.1813834611262264No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCGACGCCACCTTCGACGAC220.1813834611262264No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG220.1813834611262264No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC210.17313875834776157No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG210.17313875834776157No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG210.17313875834776157No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGCCCCCACCTTCGACGGC210.17313875834776157No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG210.17313875834776157No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG210.17313875834776157No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG200.16489405556929673No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACCAT200.16489405556929673No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG200.16489405556929673No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG190.1566493527908319No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT190.1566493527908319No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACCAT180.14840465001236705No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCGCCCCGCCTTCGGCAGC180.14840465001236705No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC180.14840465001236705No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG180.14840465001236705No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.14840465001236705No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG170.1401599472339022No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG170.1401599472339022No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACCAGACCTGCCTTCGGCAGC170.1401599472339022No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT160.1319152444554374No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG160.1319152444554374No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTAGTTTTACCCTAAACAGC160.1319152444554374No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG160.1319152444554374No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG150.12367054167697256No Hit
AGGGTTTGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACAT150.12367054167697256No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC150.12367054167697256No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTAACACATG150.12367054167697256No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.12367054167697256No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.12367054167697256No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA140.1154258388985077No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGC140.1154258388985077No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTGTCCCACCGTGACCGGC140.1154258388985077No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG140.1154258388985077No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG140.1154258388985077No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGCCCCCACCTTCGACGGC140.1154258388985077No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGACCCTACCGTGGTCGGC130.10718113612004287No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGCT130.10718113612004287No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG130.10718113612004287No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC130.10718113612004287No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG130.10718113612004287No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCTCCCTGCCTTCGGCAGC130.10718113612004287No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG130.10718113612004287No Hit

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