FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623123

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623123
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences7920
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length505-4093
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC1341.691919191919192No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1301.6414141414141417No Hit
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AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG971.224747474747475No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG901.1363636363636365No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTTGTTTTGCCTTGGGCAGC780.9848484848484848No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGGCGGT680.8585858585858586No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG640.8080808080808081No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG630.7954545454545454No Hit
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AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG560.7070707070707071No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC540.6818181818181818No Hit
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AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTTGTTTTGCCTTGGGCAGC470.5934343434343434No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG460.5808080808080808No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG400.5050505050505051No Hit
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AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG340.4292929292929293No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT340.4292929292929293No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGGCGGT330.4166666666666667No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA320.40404040404040403No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG320.40404040404040403No Hit
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AGGGTTTGATTATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGCGTCTTAAGCATG320.40404040404040403No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT310.39141414141414144No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG300.3787878787878788No Hit
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AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG290.3661616161616162No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG270.3409090909090909No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG230.2904040404040404No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCTGGTTCGCCCTTGAACGC220.2777777777777778No Hit
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AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG220.2777777777777778No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG210.2651515151515152No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC210.2651515151515152No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG200.25252525252525254No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGAGTGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG200.25252525252525254No Hit
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AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG170.21464646464646464No Hit
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AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCATGCTTAACACATG160.20202020202020202No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.1893939393939394No Hit
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AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT130.16414141414141414No Hit
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AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG130.16414141414141414No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT130.16414141414141414No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC120.15151515151515152No Hit
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GGTTACCTTGTTACGACTTCACTCCAATCATCAGCTCCACCTTAGACGGC110.1388888888888889No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCTGTGTGCCTAATACATG110.1388888888888889No Hit
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AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG100.12626262626262627No Hit
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