FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623124

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623124
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences16740
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length510-3094
%GC52

[OK]Per base sequence quality

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[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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TGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA250.14934289127837516No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT230.13739545997610514No Hit
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TGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAACATACCGTGGTAAG220.13142174432497014No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTCACCTTAGGTAGC210.12544802867383512No Hit
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GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGCCCCCGCCTTAGACGGC210.12544802867383512No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG210.12544802867383512No Hit
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