FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623127

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623127
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences8465
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length515-5301
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC5947.017129356172474No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC4184.937979917306556No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC2492.941523922031896No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC1812.138216184288246No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1792.114589486119315No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1371.618428824571766No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1271.5002953337271117No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG1231.4530419373892498No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG991.1695215593620791No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG891.0513880685174246No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC830.9805079740106319No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG830.9805079740106319No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG730.8623744831659775No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTAGATAGTCAAGTTCGACCGT710.8387477849970466No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC710.8387477849970466No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC630.7442409923213231No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG590.6969875959834613No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG570.6733608978145303No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG540.6379208505611341No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA530.6261075014766687No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG510.6024808033077377No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG490.5788541051388069No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG490.5788541051388069No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC470.5552274069698759No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG460.5434140578854105No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGCG450.531600708800945No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC430.5079740106320142No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTAGATAGTCAAGTTCGACCGT420.4961606615475487No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG410.48434731246308327No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC400.47253396337861786No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG360.425280567040756No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA340.4016538688718252No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG320.37802717070289427No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG310.3662138216184288No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG310.3662138216184288No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG290.34258712344949793No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG290.34258712344949793No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC270.31896042528056706No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTAGATAGTCAAGTTCGACCGT270.31896042528056706No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC270.31896042528056706No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA270.31896042528056706No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC260.3071470761961016No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG240.2835203780271707No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG220.2598936798582398No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG220.2598936798582398No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC220.2598936798582398No Hit
AGGGTTTGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGG220.2598936798582398No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG210.24808033077377434No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA210.24808033077377434No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG210.24808033077377434No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG200.23626698168930893No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG200.23626698168930893No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG200.23626698168930893No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGCCACTAACACCTGGGTGGCATTGGGCAAGT200.23626698168930893No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGTGGGCCGCAGCCATGTGAGGTCCAGCTGCC190.2244536326048435No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC180.212640283520378No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA180.212640283520378No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGCCACTAACACCTGGGTGGCATTGGGCAAGT180.212640283520378No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.212640283520378No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG180.212640283520378No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG170.2008269344359126No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG170.2008269344359126No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGCCACTAACACCTGGGTGGCATTGGGCAAGT170.2008269344359126No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG160.18901358535144713No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG160.18901358535144713No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG160.18901358535144713No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG160.18901358535144713No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG160.18901358535144713No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC160.18901358535144713No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.1772002362669817No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG150.1772002362669817No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.1772002362669817No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC150.1772002362669817No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA150.1772002362669817No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGCCACTAACACCTGGGTGGCATTGGGCAAGT150.1772002362669817No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA150.1772002362669817No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG140.16538688718251623No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC140.16538688718251623No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG140.16538688718251623No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG140.16538688718251623No Hit
AGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGCG140.16538688718251623No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGTGGGCCGCAGCCATGTGAGGTCCAGCTGCC140.16538688718251623No Hit
AGGGTTTGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACAT140.16538688718251623No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG140.16538688718251623No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA140.16538688718251623No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCTGTATTACCCTAGGCCGA130.1535735380980508No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG130.1535735380980508No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG130.1535735380980508No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTAGATAGTCAAGTTCGACCGT130.1535735380980508No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG130.1535735380980508No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG130.1535735380980508No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG120.14176018901358536No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG120.14176018901358536No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG120.14176018901358536No Hit
AGAGTTTGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACAT120.14176018901358536No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG120.14176018901358536No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC120.14176018901358536No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG120.14176018901358536No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACGGC120.14176018901358536No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC120.14176018901358536No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC120.14176018901358536No Hit
AGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGG120.14176018901358536No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG120.14176018901358536No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACCTTCCCCACCTTAGACGGC110.1299468399291199No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGCCACTAACACCTGGGTGGCATTGGGCAAGT110.1299468399291199No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTAGACGGC110.1299468399291199No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGCT110.1299468399291199No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC110.1299468399291199No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT110.1299468399291199No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGTGGGCCGCAGCCATGTGAGGTCCAGCTGCC110.1299468399291199No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC110.1299468399291199No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACGGC110.1299468399291199No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA110.1299468399291199No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG110.1299468399291199No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG110.1299468399291199No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG110.1299468399291199No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGTGGGCCGCAGCCATGTGAGGTCCAGCTGCC110.1299468399291199No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG110.1299468399291199No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGTGGGCCGCAGCCATGTGAGGTCCAGCTGCC100.11813349084465447No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAACCCTGCCGTGGTAATC100.11813349084465447No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG100.11813349084465447No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG100.11813349084465447No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA100.11813349084465447No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG100.11813349084465447No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG100.11813349084465447No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG100.11813349084465447No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG100.11813349084465447No Hit
GGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAG100.11813349084465447No Hit
GGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAG90.106320141760189No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGCCACTAACACCTGGGTGGCATTGGGCAAGT90.106320141760189No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG90.106320141760189No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGCCACTAACACCTGGGTGGCATTGGGCAAGT90.106320141760189No Hit
AGAGTTCGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACAT90.106320141760189No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAGCCCTACCGTGGTAAGC90.106320141760189No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG90.106320141760189No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAACATACCGTGGTAAGC90.106320141760189No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG90.106320141760189No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG90.106320141760189No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACCTTCCCCACCTTAGACGGC90.106320141760189No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCGATAGGCTTAACACATG90.106320141760189No Hit
AGGGTTCGATTCTGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGG90.106320141760189No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG90.106320141760189No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG90.106320141760189No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG90.106320141760189No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)