FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623130

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623130
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences11955
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length502-4910
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC127210.639899623588457No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA4904.098703471350899No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC4463.7306566290255123No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC4433.7055625261396905No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC2031.6980342952739438No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC1981.656210790464241No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1851.547469677959013No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1761.4721873693015475No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1601.3383521539104977No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1421.1877875365955666No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1401.1710581346716855No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1241.0372229192806357No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1231.0288582183186952No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1201.0037641154328731No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1150.9619406106231703No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA1020.8531994981179424No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC940.7862818904224174No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG900.7528230865746549No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG870.7277289836888331No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG850.7109995817649519No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC820.68590547887913No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG810.6775407779171895No Hit
TGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA770.644081974069427No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG770.644081974069427No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG740.6189878711836052No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC740.6189878711836052No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG570.4767879548306148No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG550.4600585529067336No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG540.451693851944793No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG500.41823504809703055No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG490.4098703471350899No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG480.40150564617314927No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG470.3931409452112087No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAACG450.37641154328732745No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG440.36804684232538687No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG430.3596821413634463No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG420.35131744040150564No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG410.342952739439565No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG380.3178586365537432No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG350.2927645336679214No Hit
ATGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAA350.2927645336679214No Hit
TAGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA350.2927645336679214No Hit
AGAGTTCGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT350.2927645336679214No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG320.26767043078209957No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG310.2593057298201589No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG310.2593057298201589No Hit
TGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGG300.2509410288582183No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG300.2509410288582183No Hit
AGGGTTCGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT290.2425763278962777No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG280.23421162693433709No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG270.2258469259723965No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG270.2258469259723965No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC270.2258469259723965No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG270.2258469259723965No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG270.2258469259723965No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC260.2174822250104559No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC260.2174822250104559No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT260.2174822250104559No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGCT250.20911752404851527No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT250.20911752404851527No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC250.20911752404851527No Hit
TAGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCG250.20911752404851527No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG240.20075282308657463No Hit
TGGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCG240.20075282308657463No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGAT240.20075282308657463No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG240.20075282308657463No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG230.19238812212463405No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACGCACACACTCTATCAGATGGCTACCTTG230.19238812212463405No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG230.19238812212463405No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC230.19238812212463405No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG220.18402342116269343No Hit
TAGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT210.17565872020075282No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCTAGCCCCACCTTTAACCGC200.1672940192388122No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG190.1589293182768716No Hit
ATGGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCC190.1589293182768716No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACGCACACACTCTATCAGATGGCTACCTTG190.1589293182768716No Hit
TAGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT190.1589293182768716No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG180.150564617314931No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG180.150564617314931No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.150564617314931No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG180.150564617314931No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC170.14219991635299037No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG170.14219991635299037No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG160.13383521539104978No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG160.13383521539104978No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG160.13383521539104978No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG160.13383521539104978No Hit
GATGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTA160.13383521539104978No Hit
AGGGTTCGATTCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT160.13383521539104978No Hit
AGAGTTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT160.13383521539104978No Hit
AGGGTTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT150.12547051442910914No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG150.12547051442910914No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG150.12547051442910914No Hit
TAGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT150.12547051442910914No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG150.12547051442910914No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG150.12547051442910914No Hit
ATGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCG150.12547051442910914No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACCGGTATTACCCTAGTGCGC150.12547051442910914No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.12547051442910914No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG150.12547051442910914No Hit
TAGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT130.10874111250522794No Hit
AGAGTTCGATTCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT130.10874111250522794No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT130.10874111250522794No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC130.10874111250522794No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG130.10874111250522794No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC130.10874111250522794No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCTAGCCCCACCTTTAACCGC120.10037641154328732No Hit
AGAGTTCGATTCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACAT120.10037641154328732No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAA120.10037641154328732No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTAGATAGTCAAGTTCGACCGT120.10037641154328732No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACGCACACACTCTATCAGATGGCTACCTTG120.10037641154328732No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG120.10037641154328732No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG120.10037641154328732No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG120.10037641154328732No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG120.10037641154328732No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG120.10037641154328732No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)