FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623145

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623145
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences14853
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length505-3223
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC261417.599138221234767No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC12438.368679728001077No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC4613.1037500841580825No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG4042.719989227765435No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG3042.046724567427456No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2931.9726654547902782No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2851.9188042819632398No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC2521.6966269440517066No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2521.6966269440517066No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA2001.3465293206759579No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC1991.339796674072578No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1911.2859355012455396No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC1911.2859355012455396No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG1841.238806975021881No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG1711.1512825691779438No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1621.0906887497475257No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC1501.0098969905069684No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1491.0031643439035887No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1460.9829664040934492No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG1350.9089072914562714No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG1320.8887093516461321No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1310.8819767050427523No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG1190.8011849458021948No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTATCCCACCTTAGGCGGC1140.7675217127852959No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1090.7338584797683969No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1060.7136605399582576No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC1030.6934626001481182No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG1020.6867299535447384No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC910.6126708409075607No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG760.511681141856864No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTGTCCCACCGTGACCGGC740.4982158486501044No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCACCAGACCTGCCTTCGGCAGC730.4914832020467246No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG720.48475055544334483No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT710.47801790883996503No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG680.4578199690298256No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG550.37029556318588835No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG530.3568302699791288No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG530.3568302699791288No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTCGACCAC470.31643439035885007No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG440.2962364505487107No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGGTACC430.28950380394533093No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG410.27603851073857133No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG390.2625732175318118No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG390.2625732175318118No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG390.2625732175318118No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG380.255840570928432No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAACG380.255840570928432No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG350.23564263111829262No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG350.23564263111829262No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAACCCCAATCATGCCCCCCACCTTAGGCCGA350.23564263111829262No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC330.22217733791153302No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCGCTAATCACACCCTCGGAGCA330.22217733791153302No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG320.21544469130815322No Hit
TGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA310.20871204470477345No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCACTATCCACACCTTAGATGCT300.20197939810139365No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTGGTTTTGCCTTAGGCGAT300.20197939810139365No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG300.20197939810139365No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTGGTATTACCCTTAAGCGC300.20197939810139365No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG300.20197939810139365No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG300.20197939810139365No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGTCCCAATCGCCAATCCCACCTTAGACGGC290.19524675149801388No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATTTGTTTTGCCTTGGGCAGC290.19524675149801388No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCGACGCCACCTTCGACGAC280.18851410489463408No Hit
AGGGTTTGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT280.18851410489463408No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG280.18851410489463408No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA280.18851410489463408No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG280.18851410489463408No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG280.18851410489463408No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG270.1817814582912543No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG270.1817814582912543No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG270.1817814582912543No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCGACTTTACCTTAGACGGC260.1750488116878745No Hit
AGGGTTTGATTCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT260.1750488116878745No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG250.16831616508449473No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG250.16831616508449473No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCGCTGATTCCACTGTGGACGGT240.1615835184811149No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG230.15485087187773514No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG220.14811822527435534No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG220.14811822527435534No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCGTCCCAATCGCTAGCCCCACCTTTAACCGC220.14811822527435534No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC220.14811822527435534No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG220.14811822527435534No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG220.14811822527435534No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG220.14811822527435534No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG220.14811822527435534No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG210.14138557867097556No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA200.13465293206759577No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG200.13465293206759577No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG190.127920285464216No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG190.127920285464216No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG190.127920285464216No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGA180.12118763886083621No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAA180.12118763886083621No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAGTCACTAGTTTTACCCTAAACAGC180.12118763886083621No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATTACCAGTTTTGCCCTAGGTCGC180.12118763886083621No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG180.12118763886083621No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG180.12118763886083621No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCCCTCACGAAGCATACCTTCGACAGC180.12118763886083621No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCTTTACACATG170.1144549922574564No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAATCATCTGTCCCACCGTGACCGGC170.1144549922574564No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG170.1144549922574564No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTCCTTACCAAACGTACCTTCGGCACC170.1144549922574564No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCGGTTTTACCCTAGGCCGA170.1144549922574564No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTTATCCGCCCCGCCTTCGGCAGC160.10772234565407661No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCTCCTTACCAAGCGTACCTTCGGCACC160.10772234565407661No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATG160.10772234565407661No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTAGCCCCAATCACCAGTTTTGCCCTAGGCCGT160.10772234565407661No Hit
GGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA160.10772234565407661No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTGACCCCAATCACTAGTCCTACCTTCGACGGC160.10772234565407661No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG160.10772234565407661No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATG160.10772234565407661No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATG160.10772234565407661No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG150.10098969905069682No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCAGTCCTGCCTTCGGCAGC150.10098969905069682No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG150.10098969905069682No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATG150.10098969905069682No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTAGCTACAGGCTTAACACATG150.10098969905069682No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGGATGAACGCTAGCTATAGGCTTAACACATG150.10098969905069682No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

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