FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00006623148

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006623148
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences8394
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length516-5244
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGATC5136.111508220157255No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC5116.087681677388611No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC4345.170359780795806No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGATC3954.705742196807243No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGATC3524.193471527281392No Hit
AGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC3163.7645937574457946No Hit
AGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2743.264236359304265No Hit
AGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2563.0497974743864664No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGATC2432.8949249463902786No Hit
AGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG2302.740052418394091No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAAC2222.6447462473195142No Hit
AGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1892.2516082916368836No Hit
AGGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1842.192041934715273No Hit
AGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1651.9656897784131524No Hit
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1381.6440314510364546No Hit
AGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1291.5368120085775554No Hit
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1211.4415058375029783No Hit
AGGGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1201.4295925661186561No Hit
AGGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1161.3819394805813676No Hit
AGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1131.3461996664284013No Hit
AGGGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG1131.3461996664284013No Hit
AGGGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG730.8696688110555159No Hit
AGAGTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG660.7862759113652609No Hit
AGAGTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATG630.7505360972122944No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGATCG550.6552299261377175No Hit
GGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAACG450.5360972122944961No Hit
AGGGTTTGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT390.46461758398856323No Hit
AGGGTTTGATTCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT340.40505122706695257No Hit
AGGGTTCGATTCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT290.3454848701453419No Hit
AGAGTTTGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT280.33357159876101977No Hit
GAGAGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT260.3097450559923755No Hit
AGAGTTCGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT240.28591851322373124No Hit
GGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA230.2740052418394091No Hit
AGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGATCG210.25017869907076484No Hit
GGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA210.25017869907076484No Hit
AGGGTTCGATTCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT200.23826542768644268No Hit
AGAGTTTGATTCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT190.22635215630212058No Hit
AGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC190.22635215630212058No Hit
AGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC180.21443888491779842No Hit
GGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGAT180.21443888491779842No Hit
GGGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGAT180.21443888491779842No Hit
AGAGTTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT170.20252561353347628No Hit
AGGGTTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT170.20252561353347628No Hit
AGTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAACG170.20252561353347628No Hit
AGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC160.19061234214915415No Hit
AGGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC160.19061234214915415No Hit
AGAGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT160.19061234214915415No Hit
AGAGTTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT150.17869907076483202No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC150.17869907076483202No Hit
GAGAGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT150.17869907076483202No Hit
GGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA140.16678579938050989No Hit
AGGGTTTCGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT130.15487252799618775No Hit
AGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGAT130.15487252799618775No Hit
AGGGTTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT130.15487252799618775No Hit
GTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAACG120.14295925661186562No Hit
GAGGGTTTGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT120.14295925661186562No Hit
GAGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACCCCACCGTGGTGAT120.14295925661186562No Hit
GCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAACG120.14295925661186562No Hit
AGAGTTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT120.14295925661186562No Hit
AGCTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA120.14295925661186562No Hit
GAGAGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT110.1310459852275435No Hit
AGAGTTCGATTCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT110.1310459852275435No Hit
GAGGGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT100.11913271384322134No Hit
GAGAGTTCGATTCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT100.11913271384322134No Hit
GAGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCATACCGTGGTAAA100.11913271384322134No Hit
GAGGGTTTGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT100.11913271384322134No Hit
AGGTTCGATTATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC90.10721944245889921No Hit
AGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAAGCATACCGTGGTAAGC90.10721944245889921No Hit
AGGGTTTCGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACAT90.10721944245889921No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTTTACTTCCTCTAGATAGTCAAGTTCGACCGT90.10721944245889921No Hit
AGGGTTCGATCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCTTAACACATGC90.10721944245889921No Hit
GGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGACTCCTACCGTGGTAAT90.10721944245889921No Hit
GGCTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATCGAATCATACCGTGGTAGA90.10721944245889921No Hit

[OK]Adapter Content

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