FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810005

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810005
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences17519041
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC44

[OK]Per base sequence quality

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[OK]Per tile sequence quality

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[OK]Per sequence quality scores

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[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGCTCGGTAGGTTTGTCGCCTCT1543000.880755972886872No Hit
GTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCT1201640.6859051246012838No Hit
GGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTC1199110.6844609816256495No Hit
GGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTC1036830.5918303404849614No Hit
GTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTC838250.47847938708517207No Hit
CCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCCGATC753630.43017765641395556No Hit
GTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTACTTATACTAA753090.42986942036382014No Hit
GGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCC633820.3617892098089159No Hit
CGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGT602110.34368890397596535No Hit
GGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAA564140.32201534319144526No Hit
GTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGCTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATT519690.2966429498053004No Hit
GTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTC491880.2807687932233277No Hit
GTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTG490620.28004957577301176No Hit
GCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGAC487900.2784969793723298No Hit
TATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTT483330.27588838909618396No Hit
GGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAA464670.2652371211415054No Hit
GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTA463670.26466631364125465No Hit
ATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTT420910.24025858493053356No Hit
CTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGG402900.22997834185101798No Hit
CGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGA401660.22927054055070709No Hit
ACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTAC389170.2221411548725755No Hit
CCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACC383360.21882476329611877No Hit
CTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAA364730.20819061956644774No Hit
CTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCCGATCG356200.20332163158930905No Hit
GATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTG354970.20261953836400062No Hit
CTGGAGTCTTGGAAGCTTGACTACCCTACGTTCTCCTACAAATGGACCTTGAGAGCTTGTTTGGAGGTTCTAGCA348180.1987437554372982No Hit
CCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCC339990.19406884201024474No Hit
AAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCTGTTCCTCTTTGGACTAACAGTTAAATT338300.193104177334821No Hit
GAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTG332510.1897992019083693No Hit
GCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGTTAGGTACTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCT331790.1893882205081888No Hit
GGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGC329330.18798403405757197No Hit
GCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTACTTATAC328590.18756163650738644No Hit
GTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTT324320.18512428848131585No Hit
GTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATG322930.18433086605596732No Hit
CTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACA315110.17986715140400666No Hit
GCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCT312010.1780976481532294No Hit
GTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTA307950.17578016970221144No Hit
CTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCCGA290750.16596228069789895No Hit
GGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTTGA280120.1598945969702337No Hit
CCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAAATTGACCAACCCTGGGGTTAGTAT278200.15879864656975232No Hit
TGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCT278100.15874156581972723No Hit
GCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAAATTGACCAACCCTGGGGTTAGTA276990.15810796949444894No Hit
GGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAA276990.15810796949444894No Hit
GTAAGATTTGCCGAGTTCCTTTTACTTTTTTTAACCTTTCCTTATGAGCATGCCTGTGTTGGGTTGACAGTGAGG274550.15671519919383714No Hit
GGCTGCACCATCGGGATGTCCTGATCCAACATCGAGGTCGTAAACCCTATTGTTGATATGGACTCTAGAATAGGA273320.15601310596852874No Hit
CGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGG269300.15371845981752083No Hit
GCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTGATGCTAGAG267260.15255401251700934No Hit
GTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGC263470.1503906520910591No Hit
CTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCCTTGCT257080.14674319216445694No Hit
GTTGGGTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTG257030.1467146517894444No Hit
GTTCAGATATGTTAAAGCCACTTTCGTAGTCTATTTTGTGTCAACTGGAGTTTTTTACAACTCAGGTGAGTTTTA256430.14637216728929398No Hit
GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC253560.14473394976357437No Hit
TGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGT252800.14430013606338382No Hit
GGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGT245220.13997341521148332No Hit
AGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTTG234300.13374019730874537No Hit
GGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTC229080.1307605821574366No Hit
CGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACT222230.1268505507807191No Hit
GTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCTGTTCCTCTTTGGACTAACAGTTAA215580.12305468090405176No Hit
GGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTGATGCTAGAGGTGATGTTTTTGGTAAACAGGCGGGGTAAGATTTGCCGAG215510.12301472437903421No Hit
GTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATA212130.12108539502818676No Hit
CCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCCG211910.1209598173781316No Hit
GCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGCTCGGTAGGTTTGTCGCCTCTA207990.11872225197714875No Hit
GCTACCTTTGCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTG206080.11763200965166985No Hit
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GCCGAGTTCCTTTTACTTTTTTTAACCTTTCCTTATGAGCATGCCTGTGTTGGGTTGACAGTGAGGGTAATAATG198120.11308838194967408No Hit
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GGCTAGGCTAAGCGTTTTGAGCTGCATTGCTGCGTGCTTGATGCTTGTCCCTTTTGATCGTGGTGATTTAGAGGG196370.1120894688242353No Hit
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GCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTG191290.1091897667229616No Hit
GTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGC186040.10619302734664528No Hit
GGGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGG182040.10390979734564239No Hit
CCTGTGTTGGGTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTT181450.10357302092049445No Hit
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