FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810019

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810019
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences20369959
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC44

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[FAIL]Per tile sequence quality

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[OK]Per sequence quality scores

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Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGCTCGGTAGGTTTGTCGCCTCT1818780.8928736675415007No Hit
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GGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTC1345170.6603695176804234No Hit
GTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTC1258380.6177626572542438No Hit
GGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAA1199580.5888966197722832No Hit
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GTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTC795640.3905947969752909No Hit
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GGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCC716620.3518023772163704No Hit
GTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTG695770.34156671596638954No Hit
GATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTG654760.3214341275797364No Hit
CGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGA652450.3203001046786594No Hit
CGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGT649080.31864570763249944No Hit
CTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAA644790.3165396651019278No Hit
TATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTT640170.31427161929977376No Hit
GTTCAGATATGTTAAAGCCACTTTCGTAGTTTATTTTGTGTCAACTGGAGTTTTTTACAACTCAGGTGAGTTTTA565370.2775508777410892No Hit
ATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTT551800.2708891068460177No Hit
GTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTGATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATG547600.2688272470258777No Hit
GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTG539540.26487043984722797No Hit
GTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTA531260.2608056304875233No Hit
GCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCT524830.25764902128668987No Hit
GGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGC514160.2524109155055246No Hit
CTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGG506130.24846883589701874No Hit
ACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTAC505820.24831665100553219No Hit
AAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCTGTTCCTCTTTGGACTAACAGTTAAATT482280.23676041763265207No Hit
GGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAA469630.2305502922219922No Hit
GGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTTGA462340.22697149267703484No Hit
GGCTGCACCATCGGGATGTCCTGATCCAACATCGAGGTCGTAAACCCTATTGTTGATATGGACTCTAGAATAGGA458000.22484090419622346No Hit
GAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTG455680.22370197210509848No Hit
GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC453210.22248940216325425No Hit
GCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTGATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTACTTATAC450000.22091355215786151No Hit
TGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCT428320.2102704281339005No Hit
GTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATGGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTT405980.19930329756677467No Hit
AGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTTG404660.19865528448044495No Hit
GCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAAATTGACCAACCCTGGGGTTAGTA402860.1977716302718135No Hit
GGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTC399860.19629887325742773No Hit
CCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACC399670.19620559864651668No Hit
GCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTCTGTTAGGTATTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCT389390.19115895127722154No Hit
CTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACA389350.19113931451702973No Hit
GCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTG378710.18591593630600828No Hit
CCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAAATTGACCAACCCTGGGGTTAGTAT375510.18434499549066347No Hit
GTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGC372170.18270532601464734No Hit
GTTAGGTATTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCTTCTCGTCTTGCTGTGTCATGCCCGCCTCTTC357410.17545936150386948No Hit
GCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTGATGCTAGAG355810.1746738910961971No Hit
CCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCC352620.17310785947090027No Hit
CGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATGGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGG347690.17068762877725968No Hit
CTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCCGATCG347380.17053544388577316No Hit
GTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCTGTTCCTCTTTGGACTAACAGTTAA345250.16948978640555928No Hit
GGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGT344580.16916087067234648No Hit
TGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGT336690.16528751972451197No Hit
CGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATGGTAGTTCGCTTTGACT314280.15428602482705048No Hit
GTGGGTACTTGCGCTTACTTTGTAGCCTTCATCAGGGTTTGCTGAAGATGGCGGTATATAGGCTGAGCAAGAGGT310000.1521848914865268No Hit
GTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATA309100.15174306438221108No Hit
CTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGT303690.1490871925662688No Hit
GTTGGGTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTG303520.1490037363354536No Hit
GGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGC302990.1487435492629121No Hit
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TGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTGATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTT292750.1437165386538088No Hit
GGGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGG291640.14317161855848606No Hit
GGCTGAGCAAGAGGTGGTGAGGTTGATCGGGGTTTATCGATTACAGAACAGGCTCCTCTAGAGGGATATGAAGCA288770.1417626810147237No Hit
GCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGCTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTC287610.1411932149691612No Hit
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GGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGG283190.13902335296796622No Hit
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GCCGAGTTCCTTTTACTTTTTTTAACCTTTCCTTATGAGCATGCCTGTGTTGGGTTGACAGTGAGGGTAATAATG280130.13752114081329275No Hit
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GGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTG276410.13569492211545442No Hit
GCTACCTTTGCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTG273840.13443326027313066No Hit
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CTGGAGTCTTGGAAGCTTGACTACCCTACGTTCTCCTACAAATGGACCTTGAGAGCTTGTTTGGAGGTTCTAGCA225130.11052059554955414No Hit
CTGCTGTTTCCCGTGGGGGTGTGGCTAGGCTAAGCGTTTTGAGCTGCATTGTTGCGTGCTTGATGCTTGTCCCTT224830.11037331984811555No Hit
GTAGTTTAGGACCTGTGGGTCTGTTAGGTATTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCTTCTCGTCTT223830.10988240084332031No Hit
GGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCTGTTCCTCTTTGGACTAACAG223170.10955839430015545No Hit
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CCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGA204060.10017693211851826No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

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