FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810023

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810023
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences17955687
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC44

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Sequence length distribution

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[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCC676930.3770003342116623No Hit
GTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTG631370.3516267575838229No Hit
CGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGT614250.3420921739168209No Hit
GATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTG592760.3301238209376227No Hit
CGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGA590920.32909907596406646No Hit
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GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTG495960.2762133245027049No Hit
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GCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCT483060.2690289711554896No Hit
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GGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTTGA428910.2388713948956673No Hit
GGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAA425760.23711707605506824No Hit
GCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTGATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTACTTATAC420400.2341319493929695No Hit
GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC416620.23202676678425058No Hit
GAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTG411720.22929782636554089No Hit
TGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCT391580.21808132431802804No Hit
GCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAAATTGACCAACCCTGGGGTTAGTA383280.21345883340470345No Hit
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CCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACC374310.2084632016586166No Hit
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GCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTCTGTTAGGTATTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCT370220.2061853717989181No Hit
GGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTC364910.2032280914676225No Hit
CCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAAATTGACCAACCCTGGGGTTAGTAT354790.1975919941130629No Hit
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TGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGT306670.1707926853481017No Hit
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GGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGC275560.15346669832237553No Hit
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GGCTGAGCAAGAGGTGGTGAGGTTGATCGGGGTTTATCGATTACAGAACAGGCTCCTCTAGAGGGATATGAAGCA265760.14800881748495615No Hit
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