FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810103

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810103
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences3901600
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC48

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[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAA142920.36631125692023786No Hit
GCTACCTTTGCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTG138990.3562384662702481No Hit
GTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGCTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATT132820.3404244412548698No Hit
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GGGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGG123870.31748513430387537No Hit
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CCCTGTTCTTGGGTGGGTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAG121530.31148759483288907No Hit
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GATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTG111870.2867285216321509No Hit
GTGAGTTTTAGCTTTATTGGGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATC110470.2831402501537831No Hit
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GGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAA109150.2797570227598934No Hit
GCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGAC108540.2781935616157474No Hit
GTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGT102780.26343038753331965No Hit
GGCTGCACCATCGGGATGTCCTGATCCAACATCGAGGTCGTAAACCCTATTGTTGATATGGACTCTAGAATAGGA101550.2602778347344679No Hit
GGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTC98770.2531525527988518No Hit
CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGT97740.2505126102111954No Hit
GTGATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCT97250.24925671519376666No Hit
GTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATA96500.2473344269017839No Hit
GTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTT92730.23767172442075044No Hit
CCCCGAGCCACCTTCCCCGCCGGGCCTTCCCAGCCGTCCCGGAGCCGGTCGCGGCGCACCGCCGCGGTGGAAATG89870.23034139840065615No Hit
GTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTC89650.2297775271683412No Hit
GCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCC87560.22442075046134918No Hit
GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC85830.2199866721345089No Hit
GGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTC84710.21711605495181463No Hit
CTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATA84160.21570637687102728No Hit
GTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTCCGACCTGGGCCG83930.21511687512815256No Hit
CTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCG80630.20665880664342834No Hit
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CGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGG78940.20232725035882715No Hit
GCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTG78770.20189153167931104No Hit
GCTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCAT76610.19635534139840066No Hit
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GGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGT75170.19266454787779372No Hit
GGACTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGT75120.1925363953249949No Hit
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GCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTGATGCTAGAG73260.1877691203608776No Hit
CTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATA72580.1860262456428132No Hit
CCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGTTAGGTACTGTTTGCATTAATAA72040.1846421980725856No Hit
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GGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTG68390.1752870617182694No Hit
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CCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTC63160.16188230469550954No Hit
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GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTA61440.15747385687922905No Hit
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GTTGGGTTCTGCTCCGAGGTCGCCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGT58080.14886200533114619No Hit
GGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCC57900.14840065614107031No Hit
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TGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGT56620.14511995078941972No Hit
GGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTC54360.13932745540291164No Hit
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GGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAA53330.1366875128152553No Hit
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GCTGTTTCCCGTGGGGGTGTGGCTAGGCTAAGCGTTTTGAGCTGCATTGCTGCGTGCTTGATGCTTGTCCCTTTT50970.13063871232314947No Hit
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CCTGTTCTTGGGTGGGTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGT49390.12658909165470578No Hit
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