FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810105

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810105
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences3905171
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC48

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SequenceCountPercentagePossible Source
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GTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGCTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATT134690.344901670118927No Hit
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GGGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGG127860.3274120390630782No Hit
GGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGCTCGGTAGGTTTGTCGCCTCT126600.32418554782876347No Hit
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CGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGA117980.30211225065432473No Hit
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GGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAA110730.28354712252037106No Hit
GTGAGTTTTAGCTTTATTGGGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATC109320.2799365251867332No Hit
GCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGAC108380.27752946029764125No Hit
GGCTGCACCATCGGGATGTCCTGATCCAACATCGAGGTCGTAAACCCTATTGTTGATATGGACTCTAGAATAGGA105450.2700265878241952No Hit
GTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGT104600.2678499865946971No Hit
GTGATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCT101160.2590411533835522No Hit
CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGT99410.25455991555811514No Hit
GGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTC98780.25294666994095777No Hit
GTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATA97560.2498226069997959No Hit
GTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTT91920.23538021766524433No Hit
GTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTC89770.2298746969082788No Hit
GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC87860.22498374591023032No Hit
GCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCC85620.21924776149367084No Hit
GGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTC83470.21374224073670522No Hit
GTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTCCGACCTGGGCCG83080.21274356487846496No Hit
CTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATA82920.2123338517058536No Hit
CCCCGAGCCACCTTCCCCGCCGGGCCTTCCCAGCCGTCCCGGAGCCGGTCGCGGCGCACCGCCGCGGTGGAAATG81620.20900493217838606No Hit
GCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTG80660.20654665314271767No Hit
CGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGG80010.2048821933789839No Hit
CTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCG79760.20424201654677862No Hit
CTGCTGTTTCCCGTGGGGGTGTGGCTAGGCTAAGCGTTTTGAGCTGCATTGCTGCGTGCTTGATGCTTGTCCCTT79430.20339698312826765No Hit
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GGACTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGT76100.19486982772329303No Hit
GGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGT76090.19484422065000484No Hit
GCTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCAT75340.19292369015338895No Hit
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CTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATA73270.18762302598272906No Hit
GGGGTTAGTCCTTGCTATATTATGCTTGGTTATAATTTTTCATCTTTCCCTTGCGGTACTATATCTATTGCGCCA72540.18575370963268958No Hit
GGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAAT72520.18570249548611317No Hit
GGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTG70540.18063229497504718No Hit
AGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTTG70320.18006893936270651No Hit
CCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGTTAGGTACTGTTTGCATTAATAA69530.17804598057293777No Hit
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CTCGGAGGTTGGGTTCTGCTCCGAGGTCGCCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTG67470.1727709234755661No Hit
GCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGTTAGGTACTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCT65050.1665740117398188No Hit
CCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTC63140.16168306074177033No Hit
GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTA62450.15991617268488373No Hit
GCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCT61550.15761153608894463No Hit
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GCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTACTTATAC60200.154154581195036No Hit
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TGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGT59700.1528742275306254No Hit
GTTGGGTTCTGCTCCGAGGTCGCCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGT58930.1509024828874331No Hit
CCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACCCGATC58050.14864906043807044No Hit
GGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCC57550.14736870677365985No Hit
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GGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGG56820.1454993904236204No Hit
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GGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAA55410.14188879308998248No Hit
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GGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTC54580.1397634060070609No Hit
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GTGGGTACTTGCGCTTACTTTGTAGCCTTCATCAGGGTTTGCTGAAGATGGCGGTATATAGGCTGAGCAAGAGGT54010.1383038028296328No Hit
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GCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGCTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTC52480.1343859206165364No Hit
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GGCTCCTCTAGAGGGATATGAAGCACCGCCAGGTCCTTTGAGTTTTAAGCTGTGGCTCGTAGTGTTCTGGCGAGC42640.10918856050093581No Hit
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