FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810117

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810117
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences3933239
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC48

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[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTG159700.40602668691121996No Hit
GGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGGCACGAA147120.37404286899423095No Hit
GCTACCTTTGCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTG141790.3604916965381458No Hit
GTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGCTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATT135750.3451353960438204No Hit
GGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGC135530.34457606059535156No Hit
GGGGATTTAGAGGGTTCTGTGGGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGG129230.3285587272982903No Hit
GGCAAATTTAAAGTTGAACTAAGATTCTATCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGCTCGGTAGGTTTGTCGCCTCT128640.3270586913228512No Hit
CCCTGTTCTTGGGTGGGTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAG126840.32248231038083375No Hit
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GTTCAGATATGTTAAAGCCACTTTCGTAGTCTATTTTGTGTCAACTGGAGTTTTTTACAACTCAGGTGAGTTTTA115570.29382908081609077No Hit
GTGAGTTTTAGCTTTATTGGGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATC112590.2862526279231951No Hit
GGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAA111480.28343052634228433No Hit
GCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGAC111260.2828711908938155No Hit
GTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGT106350.2703878406575344No Hit
GGCTGCACCATCGGGATGTCCTGATCCAACATCGAGGTCGTAAACCCTATTGTTGATATGGACTCTAGAATAGGA104780.26639621950255243No Hit
GGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTC100710.25604851370587955No Hit
GTGATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCT100330.2550823888403425No Hit
CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGT99390.25269250101506674No Hit
GTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATA98540.2505314322368918No Hit
GTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTT94570.2404379698258865No Hit
GTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTC92760.23583616454530223No Hit
GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC90410.2298614449821127No Hit
GCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCC89200.22678510001553429No Hit
GGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTC85610.21765776247006605No Hit
CTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATA85230.216691637604529No Hit
GTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTCCGACCTGGGCCG84510.21486108522772196No Hit
CTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCG83170.2114542238597756No Hit
GCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTG83110.21130167782837506No Hit
CCCCGAGCCACCTTCCCCGCCGGGCCTTCCCAGCCGTCCCGGAGCCGGTCGCGGCGCACCGCCGCGGTGGAAATG81830.20804736249182926No Hit
CGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGG81750.20784396778329514No Hit
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CTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATA78960.20075057732316803No Hit
CTGCTGTTTCCCGTGGGGGTGTGGCTAGGCTAAGCGTTTTGAGCTGCATTGCTGCGTGCTTGATGCTTGTCCCTT77530.19711489690812076No Hit
GCTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCAT76590.19472500908284496No Hit
GGACTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGT75640.19230969691900238No Hit
GCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTGATGCTAGAG75170.19111475300636446No Hit
GGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGT74630.18974183872375922No Hit
GGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAAT73820.18768246729985136No Hit
GGGGTTAGTCCTTGCTATATTATGCTTGGTTATAATTTTTCATCTTTCCCTTGCGGTACTATATCTATTGCGCCA73210.18613158264727875No Hit
GGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTG72010.1830806620192671No Hit
AGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTTG71410.18155520170526124No Hit
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CCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTC63430.16126657952898363No Hit
GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTA63340.16103776048188276No Hit
TGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGT61810.15714783668116786No Hit
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CCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACC61060.15524101128866055No Hit
GCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCT60930.15491049488729264No Hit
GCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTACTTATAC60870.15475794885589206No Hit
GTTGGGTTCTGCTCCGAGGTCGCCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGT59380.15096972240944423No Hit
GGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGG58810.1495205351111387No Hit
CTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGG58370.14840186421420107No Hit
TATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTT58180.14791880178143255No Hit
GGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCC57680.14664758485309434No Hit
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GGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTC55940.14222374994247744No Hit
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GGGGTCTCGCTATGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGG52830.13431678064821387No Hit
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CCTGTTCTTGGGTGGGTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGT52500.13347777747551065No Hit
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GTTCCTTTTACTTTTTTTAACCTTTCCTTATGAGCATGCCTGTGTTGGGTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTG43550.11072299445825692No Hit
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GTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCT42030.1068584949961088No Hit
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