FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810133

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810133
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences3916198
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC48

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[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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GCTACCTTTGCACGGTTAGGGTACCGCGGCCGTTAAACATGTGTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTG137250.3504674687030635No Hit
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GGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAA111620.28502133957476106No Hit
GTGAGTTTTAGCTTTATTGGGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATC110970.28336156649893596No Hit
GCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGAC110300.2816507234823163No Hit
GTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGT106750.27258580899127166No Hit
GGCTGCACCATCGGGATGTCCTGATCCAACATCGAGGTCGTAAACCCTATTGTTGATATGGACTCTAGAATAGGA102960.2629080552106916No Hit
GGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTC100500.2566264524929536No Hit
CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGT99660.2544815149795797No Hit
GTGATAGATTGGTCCAATTGGGTGTGAGGAGTTCAGTTATATGTTTGGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCT97560.24911917119614485No Hit
GTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATA95760.24452287652462923No Hit
GTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTT94880.2422757991296661No Hit
GTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTC93970.23995211682351097No Hit
GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC90080.23001901333895783No Hit
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GGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTC85760.21898790612732044No Hit
CTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATA84840.21663868885076798No Hit
GTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTCCGACCTGGGCCG83450.21308932796554209No Hit
CTCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCG81410.20788019400449106No Hit
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CCCCGAGCCACCTTCCCCGCCGGGCCTTCCCAGCCGTCCCGGAGCCGGTCGCGGCGCACCGCCGCGGTGGAAATG79010.20175180110913699No Hit
GAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAATCGTT78890.20144538146436927No Hit
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CTGCTGTTTCCCGTGGGGGTGTGGCTAGGCTAAGCGTTTTGAGCTGCATTGCTGCGTGCTTGATGCTTGTCCCTT78030.1992493740102007No Hit
GCTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCAT76990.1965937370888806No Hit
CTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATA75400.1925336767957085No Hit
GGACTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGT75260.19217618721014618No Hit
GGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGT74850.1911292534238565No Hit
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GGGGTTAGTCCTTGCTATATTATGCTTGGTTATAATTTTTCATCTTTCCCTTGCGGTACTATATCTATTGCGCCA72370.18479658076532393No Hit
GGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAAT71790.18331555248228001No Hit
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GGGATTTTTTAGGTAGTGGGTGTTGAGCTTGAACGCTTTCTTAATTGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTG69610.17774892893566668No Hit
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GTCAACTGGAGTTTTTTACAACTCAGGTGAGTTTTAGCTTTATTGGGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACG68990.17616576077103355No Hit
CTCGGAGGTTGGGTTCTGCTCCGAGGTCGCCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTG68330.17448045272481114No Hit
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GCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGTTAGGTACTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCT66180.16899043408938977No Hit
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GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTA62370.15926161036801512No Hit
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CCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCATATTGATGCCGAACTTAGTGCGGACACC60330.1540524764069641No Hit
GATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTTGGGTTCTGCTCC59780.1526480530351121No Hit
GTTGGGTTCTGCTCCGAGGTCGCCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGT58530.14945618173544853No Hit
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CGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGCTCGTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAG53380.1363056719808345No Hit
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CCTGTTCTTGGGTGGGTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGT52310.13357343014832243No Hit
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GTCACTGGGCAGGCGGTGCCTCTAATACTGGTGATGCTAGAGGTGATGTTTTTGGTAAACAGGCGGGGTAAGATT46280.11817584299874521No Hit
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