FastQCFastQC Report
Sat 22 Oct 2022
EGAF00006810135

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00006810135
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences3864797
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC48

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[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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CCCTGTTCTTGGGTGGGTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAG124370.3218021541623014No Hit
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GTGAGTTTTAGCTTTATTGGGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATC110500.28591411140093514No Hit
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GGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAA108910.2818000531463878No Hit
GCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGAC107110.2771426287072775No Hit
GGCTGCACCATCGGGATGTCCTGATCCAACATCGAGGTCGTAAACCCTATTGTTGATATGGACTCTAGAATAGGA102190.26441233524037616No Hit
GTCCTTTCGTACAGGGAGGAATTTGAAGTAGATAGAAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGT101970.263843094475596No Hit
GGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTC98460.254761116819331No Hit
GTCTGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATA98290.25432124895563724No Hit
CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGT97340.25186316383499574No Hit
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GTCGCCTCTACCTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGCTGTTCTTAGGTAGC87700.22692006850553859No Hit
GGCTGGAGTGCAGTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTC83060.21491426328472105No Hit
GTGGCTATTCACAGGCGCGATCCCACTACTGATCAGCACGGGAGTTTTGACCTGCTCCGTTTCCGACCTGGGCCG83020.2148107649638519No Hit
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CTGCTGTTTCCCGTGGGGGTGTGGCTAGGCTAAGCGTTTTGAGCTGCATTGCTGCGTGCTTGATGCTTGTCCCTT75780.1960775688865418No Hit
GGACTCTAGAATAGGATTGCGCTGTTATCCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGT74880.19374885666698663No Hit
GCTCCGTTTCCGACCTGGGCCGGTTCACCCCTCCTTAGGCAACCTGGTGGTCCCCCGCTCCCGGGAGGTCACCAT73630.19051453413982675No Hit
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GGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTAATCTGACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAAT70940.18355427206137864No Hit
GGGGTTAGTCCTTGCTATATTATGCTTGGTTATAATTTTTCATCTTTCCCTTGCGGTACTATATCTATTGCGCCA69990.18109618694073712No Hit
CCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGTTAGGTACTGTTTGCATTAATAA69720.18039757327487058No Hit
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GTCAACTGGAGTTTTTTACAACTCAGGTGAGTTTTAGCTTTATTGGGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACG66600.17232470424707946No Hit
GCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGTTAGGTACTGTTTGCATTAATAAATTAAAGCTCCATAGGGTCT64280.1663218016366707No Hit
GCTGCTTTTAGGCCTACTATGGGTGTTAAATTTTTTACTCTCTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCT60790.15729157314084027No Hit
GTTGACAGTGAGGGTAATAATGACTTGTTGGTTGATTGTAGATATTGGGCTGTTAATTGTCAGTTCAGTGTTTTA60580.1567482069562774No Hit
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CCCTAGGGTAACTTGTTCCGTTGGTCAAGTTATTGGATCAATTGAGTATAGTAGTTCGCTTTGACTGGTGAAGTC58890.1523754028995572No Hit
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TGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGTAGGCCTTATTTCTCTTGT57740.1493998261745701No Hit
GTTGGGTTCTGCTCCGAGGTCGCCCCAACCGAAATTTTTAATGCAGGTTTGGTAGTTTAGGACCTGTGGGTTTGT57320.14831309380544438No Hit
GGGAGGGGGTGATCTAAAACACTCTTTACGCCGGCTTCTATTGACTTGGGTTAATCGTGTGACCGCGGTGGCTGG56680.14665712067153852No Hit
GGGGTCTTAGCTTTGGCTCTCCTTGCAAAGTTATTTCTAGTTAATTCATTATGCAGAAGGTATAGGGGTTAGTCC56330.14575151036393372No Hit
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CCTGTTCTTGGGTGGGTGTGGGTATAATACTAAGTTGAGATGATATCATTTACGGGGGAAGGCGCTTTGTGAAGT50500.13066663009725996No Hit
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