FastQCFastQC Report
Thu 15 Dec 2022
EGAF00007701575

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00007701575
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length250-251
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCTGTTTGCTACCCACACTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTGGTGCCCAGTA416.666666666666664No Hit
CCTGTTCGATACCCGCACTTTCGAGCTTCAGCGTCAGTTGCGCTCCAGTG312.5No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAGTGTCAGTAGCAGTCCAGTA28.333333333333332No Hit
CCTGTTCGCTCCCCTAGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTGGCGGCCCAGAA28.333333333333332No Hit
CCTGTTCGCTCCCCCAGCTTTCGCGCCTCAGCGTCAGTAGCGGCCCAGAA14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTACCGTCCAGTA14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTACCCATGCTTTCGAGCCTCAGCGTCAGTTGGTGCCCAGTA14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACACTTTCGTGCCTCAACGTCAGTTATTGTCCAGAA14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGAGCCTCAGTGTCAGTTACAGTCCAGTG14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCACGCTTTCGAGCCTCAACGTCAGTCATCGTCCAGCAAG14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAGTGTCAGTTTCAGTACAGAA14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGATACCCGCACTTTCGAGCTTCAGCGTCAGTTGCGCTCCAGTG14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGTGTCAGTTACAGTCCAGTG14.166666666666666No Hit
CCTATTCGCTCCCCCAGCTTTCACGCCTCAGCGTCGGTCTCGGCCCAGAG14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGATACCCGCACTTTCGCGCTTCAGCGTCAGTTGCGCTCCAGTG14.166666666666666No Hit
CCTGTTCGCTCCTCTAGCTTTCGCGCCTCCGCGTCAGTGGCGGCCCAGAA14.166666666666666No Hit
CCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAGTGTCAGTTTCAGTCCAGAA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)